Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trem3Q9JKE1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trem3Q9JKE1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trem3Q9JKE1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trem3Q9JKE1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trem3Q9JKE1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trem3Q9JKE1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trem3Q9JKE1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trem3Q9JKE1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trem3Q9JKE1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem3Q9JKE1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem3Q9JKE1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem3Q9JKE1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem3Q9JKE1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem3Q9JKE1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem3Q9JKE1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem3Q9JKE1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem3Q9JKE1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem3Q9JKE1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trem3Q9JKE1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trem3Q9JKE1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trem3Q9JKE1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trem3Q9JKE1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trem3Q9JKE1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trem3Q9JKE1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trem3Q9JKE1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trem3Q9JKE1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trem3Q9JKE1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trem3Q9JKE1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trem3Q9JKE1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trem3Q9JKE1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trem3Q9JKE1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trem3Q9JKE1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trem3Q9JKE1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trem3Q9JKE1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trem3Q9JKE1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trem3Q9JKE1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trem3Q9JKE1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Trem3Q9JKE1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trem3Q9JKE1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms