Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Uchl3Q9JKB1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Uchl3Q9JKB1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Uchl3Q9JKB1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Uchl3Q9JKB1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Uchl3Q9JKB1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Uchl3Q9JKB1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Uchl3Q9JKB1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Uchl3Q9JKB1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Uchl3Q9JKB1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Uchl3Q9JKB1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Uchl3Q9JKB1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Uchl3Q9JKB1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Uchl3Q9JKB1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Uchl3Q9JKB1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Uchl3Q9JKB1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Uchl3Q9JKB1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Uchl3Q9JKB1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Uchl3Q9JKB1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Uchl3Q9JKB1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Uchl3Q9JKB1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Uchl3Q9JKB1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uchl3Q9JKB1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uchl3Q9JKB1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uchl3Q9JKB1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uchl3Q9JKB1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uchl3Q9JKB1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uchl3Q9JKB1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uchl3Q9JKB1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uchl3Q9JKB1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Uchl3Q9JKB1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Uchl3Q9JKB1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Uchl3Q9JKB1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Uchl3Q9JKB1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Uchl3Q9JKB1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Uchl3Q9JKB1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Uchl3Q9JKB1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Uchl3Q9JKB1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Uchl3Q9JKB1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Uchl3Q9JKB1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Uchl3Q9JKB1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uchl3Q9JKB1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uchl3Q9JKB1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uchl3Q9JKB1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uchl3Q9JKB1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uchl3Q9JKB1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms