Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc86Q9JJ89 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc86Q9JJ89 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc86Q9JJ89 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc86Q9JJ89 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc86Q9JJ89 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc86Q9JJ89 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc86Q9JJ89 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc86Q9JJ89 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc86Q9JJ89 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc86Q9JJ89 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc86Q9JJ89 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc86Q9JJ89 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc86Q9JJ89 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc86Q9JJ89 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc86Q9JJ89 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc86Q9JJ89 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc86Q9JJ89 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc86Q9JJ89 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc86Q9JJ89 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc86Q9JJ89 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc86Q9JJ89 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc86Q9JJ89 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc86Q9JJ89 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc86Q9JJ89 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc86Q9JJ89 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc86Q9JJ89 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc86Q9JJ89 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc86Q9JJ89 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc86Q9JJ89 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc86Q9JJ89 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc86Q9JJ89 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc86Q9JJ89 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc86Q9JJ89 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc86Q9JJ89 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc86Q9JJ89 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc86Q9JJ89 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc86Q9JJ89 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc86Q9JJ89 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc86Q9JJ89 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc86Q9JJ89 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc86Q9JJ89 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc86Q9JJ89 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc86Q9JJ89 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc86Q9JJ89 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc86Q9JJ89 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc86Q9JJ89 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc86Q9JJ89 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc86Q9JJ89 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc86Q9JJ89 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc86Q9JJ89 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc86Q9JJ89 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc86Q9JJ89 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc86Q9JJ89 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc86Q9JJ89 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc86Q9JJ89 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc86Q9JJ89 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc86Q9JJ89 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc86Q9JJ89 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc86Q9JJ89 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc86Q9JJ89 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc86Q9JJ89 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc86Q9JJ89 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc86Q9JJ89 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc86Q9JJ89 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc86Q9JJ89 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc86Q9JJ89 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc86Q9JJ89 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc86Q9JJ89 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc86Q9JJ89 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc86Q9JJ89 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc86Q9JJ89 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc86Q9JJ89 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc86Q9JJ89 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc86Q9JJ89 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc86Q9JJ89 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc86Q9JJ89 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc86Q9JJ89 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc86Q9JJ89 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc86Q9JJ89 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc86Q9JJ89 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc86Q9JJ89 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc86Q9JJ89 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc86Q9JJ89 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc86Q9JJ89 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc86Q9JJ89 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc86Q9JJ89 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc86Q9JJ89 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc86Q9JJ89 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc86Q9JJ89 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc86Q9JJ89 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc86Q9JJ89 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc86Q9JJ89 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc86Q9JJ89 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc86Q9JJ89 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc86Q9JJ89 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc86Q9JJ89 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc86Q9JJ89 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc86Q9JJ89 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc86Q9JJ89 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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