Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIE3

Otor, Otoraplin, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtorQ9JIE3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtorQ9JIE3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtorQ9JIE3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtorQ9JIE3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtorQ9JIE3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtorQ9JIE3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtorQ9JIE3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
OtorQ9JIE3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtorQ9JIE3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
OtorQ9JIE3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtorQ9JIE3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtorQ9JIE3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtorQ9JIE3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtorQ9JIE3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtorQ9JIE3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtorQ9JIE3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtorQ9JIE3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtorQ9JIE3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtorQ9JIE3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtorQ9JIE3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtorQ9JIE3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
OtorQ9JIE3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtorQ9JIE3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtorQ9JIE3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtorQ9JIE3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtorQ9JIE3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtorQ9JIE3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtorQ9JIE3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtorQ9JIE3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
OtorQ9JIE3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OtorQ9JIE3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
OtorQ9JIE3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OtorQ9JIE3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OtorQ9JIE3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms