Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI11

Stk4, Serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk4Q9JI11 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stk4Q9JI11 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stk4Q9JI11 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Stk4Q9JI11 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stk4Q9JI11 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stk4Q9JI11 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stk4Q9JI11 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stk4Q9JI11 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stk4Q9JI11 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stk4Q9JI11 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Stk4Q9JI11 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stk4Q9JI11 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stk4Q9JI11 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stk4Q9JI11 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Stk4Q9JI11 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stk4Q9JI11 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stk4Q9JI11 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stk4Q9JI11 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stk4Q9JI11 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stk4Q9JI11 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stk4Q9JI11 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stk4Q9JI11 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stk4Q9JI11 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stk4Q9JI11 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stk4Q9JI11 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stk4Q9JI11 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stk4Q9JI11 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stk4Q9JI11 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stk4Q9JI11 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stk4Q9JI11 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stk4Q9JI11 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stk4Q9JI11 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stk4Q9JI11 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stk4Q9JI11 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Stk4Q9JI11 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stk4Q9JI11 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stk4Q9JI11 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stk4Q9JI11 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stk4Q9JI11 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stk4Q9JI11 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stk4Q9JI11 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Stk4Q9JI11 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stk4Q9JI11 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stk4Q9JI11 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stk4Q9JI11 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stk4Q9JI11 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stk4Q9JI11 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stk4Q9JI11 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stk4Q9JI11 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stk4Q9JI11 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stk4Q9JI11 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stk4Q9JI11 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stk4Q9JI11 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stk4Q9JI11 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stk4Q9JI11 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stk4Q9JI11 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Stk4Q9JI11 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stk4Q9JI11 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stk4Q9JI11 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stk4Q9JI11 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stk4Q9JI11 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stk4Q9JI11 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stk4Q9JI11 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stk4Q9JI11 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stk4Q9JI11 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stk4Q9JI11 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Stk4Q9JI11 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stk4Q9JI11 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stk4Q9JI11 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stk4Q9JI11 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stk4Q9JI11 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stk4Q9JI11 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stk4Q9JI11 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stk4Q9JI11 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stk4Q9JI11 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stk4Q9JI11 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stk4Q9JI11 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stk4Q9JI11 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stk4Q9JI11 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stk4Q9JI11 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stk4Q9JI11 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stk4Q9JI11 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stk4Q9JI11 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stk4Q9JI11 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stk4Q9JI11 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stk4Q9JI11 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Stk4Q9JI11 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Stk4Q9JI11 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stk4Q9JI11 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stk4Q9JI11 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stk4Q9JI11 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stk4Q9JI11 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stk4Q9JI11 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Stk4Q9JI11 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Stk4Q9JI11 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stk4Q9JI11 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stk4Q9JI11 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stk4Q9JI11 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stk4Q9JI11 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stk4Q9JI11 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms