Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK4

Cse1l, Exportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cse1lQ9ERK4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cse1lQ9ERK4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cse1lQ9ERK4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cse1lQ9ERK4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cse1lQ9ERK4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cse1lQ9ERK4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cse1lQ9ERK4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cse1lQ9ERK4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cse1lQ9ERK4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cse1lQ9ERK4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cse1lQ9ERK4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cse1lQ9ERK4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cse1lQ9ERK4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cse1lQ9ERK4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cse1lQ9ERK4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cse1lQ9ERK4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cse1lQ9ERK4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cse1lQ9ERK4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cse1lQ9ERK4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cse1lQ9ERK4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cse1lQ9ERK4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cse1lQ9ERK4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cse1lQ9ERK4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cse1lQ9ERK4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cse1lQ9ERK4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cse1lQ9ERK4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cse1lQ9ERK4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cse1lQ9ERK4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cse1lQ9ERK4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cse1lQ9ERK4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cse1lQ9ERK4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cse1lQ9ERK4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cse1lQ9ERK4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cse1lQ9ERK4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cse1lQ9ERK4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cse1lQ9ERK4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cse1lQ9ERK4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cse1lQ9ERK4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cse1lQ9ERK4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cse1lQ9ERK4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cse1lQ9ERK4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cse1lQ9ERK4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cse1lQ9ERK4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cse1lQ9ERK4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cse1lQ9ERK4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cse1lQ9ERK4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cse1lQ9ERK4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cse1lQ9ERK4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cse1lQ9ERK4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cse1lQ9ERK4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cse1lQ9ERK4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cse1lQ9ERK4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cse1lQ9ERK4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cse1lQ9ERK4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cse1lQ9ERK4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cse1lQ9ERK4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cse1lQ9ERK4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cse1lQ9ERK4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cse1lQ9ERK4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cse1lQ9ERK4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cse1lQ9ERK4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cse1lQ9ERK4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cse1lQ9ERK4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cse1lQ9ERK4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cse1lQ9ERK4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cse1lQ9ERK4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cse1lQ9ERK4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cse1lQ9ERK4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cse1lQ9ERK4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cse1lQ9ERK4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cse1lQ9ERK4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cse1lQ9ERK4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cse1lQ9ERK4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cse1lQ9ERK4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cse1lQ9ERK4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cse1lQ9ERK4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cse1lQ9ERK4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cse1lQ9ERK4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cse1lQ9ERK4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cse1lQ9ERK4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cse1lQ9ERK4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cse1lQ9ERK4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cse1lQ9ERK4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cse1lQ9ERK4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cse1lQ9ERK4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cse1lQ9ERK4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cse1lQ9ERK4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cse1lQ9ERK4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cse1lQ9ERK4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cse1lQ9ERK4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cse1lQ9ERK4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cse1lQ9ERK4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cse1lQ9ERK4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cse1lQ9ERK4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cse1lQ9ERK4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cse1lQ9ERK4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cse1lQ9ERK4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cse1lQ9ERK4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cse1lQ9ERK4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cse1lQ9ERK4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms