Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndst3Q9EQH7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndst3Q9EQH7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndst3Q9EQH7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndst3Q9EQH7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndst3Q9EQH7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndst3Q9EQH7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndst3Q9EQH7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndst3Q9EQH7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndst3Q9EQH7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndst3Q9EQH7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndst3Q9EQH7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndst3Q9EQH7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndst3Q9EQH7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndst3Q9EQH7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndst3Q9EQH7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndst3Q9EQH7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndst3Q9EQH7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndst3Q9EQH7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndst3Q9EQH7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndst3Q9EQH7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndst3Q9EQH7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ndst3Q9EQH7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ndst3Q9EQH7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ndst3Q9EQH7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ndst3Q9EQH7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ndst3Q9EQH7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ndst3Q9EQH7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ndst3Q9EQH7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ndst3Q9EQH7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ndst3Q9EQH7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ndst3Q9EQH7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ndst3Q9EQH7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ndst3Q9EQH7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ndst3Q9EQH7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ndst3Q9EQH7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ndst3Q9EQH7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndst3Q9EQH7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndst3Q9EQH7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndst3Q9EQH7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndst3Q9EQH7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndst3Q9EQH7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndst3Q9EQH7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndst3Q9EQH7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndst3Q9EQH7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ndst3Q9EQH7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ndst3Q9EQH7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ndst3Q9EQH7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ndst3Q9EQH7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ndst3Q9EQH7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ndst3Q9EQH7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ndst3Q9EQH7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ndst3Q9EQH7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ndst3Q9EQH7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ndst3Q9EQH7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ndst3Q9EQH7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ndst3Q9EQH7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ndst3Q9EQH7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ndst3Q9EQH7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ndst3Q9EQH7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ndst3Q9EQH7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ndst3Q9EQH7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ndst3Q9EQH7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ndst3Q9EQH7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ndst3Q9EQH7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ndst3Q9EQH7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ndst3Q9EQH7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ndst3Q9EQH7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ndst3Q9EQH7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ndst3Q9EQH7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ndst3Q9EQH7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ndst3Q9EQH7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ndst3Q9EQH7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ndst3Q9EQH7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ndst3Q9EQH7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ndst3Q9EQH7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ndst3Q9EQH7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ndst3Q9EQH7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ndst3Q9EQH7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ndst3Q9EQH7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ndst3Q9EQH7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ndst3Q9EQH7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ndst3Q9EQH7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndst3Q9EQH7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndst3Q9EQH7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndst3Q9EQH7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndst3Q9EQH7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndst3Q9EQH7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndst3Q9EQH7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndst3Q9EQH7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndst3Q9EQH7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndst3Q9EQH7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndst3Q9EQH7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndst3Q9EQH7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ndst3Q9EQH7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ndst3Q9EQH7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ndst3Q9EQH7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ndst3Q9EQH7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ndst3Q9EQH7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ndst3Q9EQH7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms