Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syde1Q9DBZ9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syde1Q9DBZ9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syde1Q9DBZ9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syde1Q9DBZ9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Syde1Q9DBZ9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syde1Q9DBZ9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syde1Q9DBZ9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Syde1Q9DBZ9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syde1Q9DBZ9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syde1Q9DBZ9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syde1Q9DBZ9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syde1Q9DBZ9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syde1Q9DBZ9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syde1Q9DBZ9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syde1Q9DBZ9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syde1Q9DBZ9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syde1Q9DBZ9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syde1Q9DBZ9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syde1Q9DBZ9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syde1Q9DBZ9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syde1Q9DBZ9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syde1Q9DBZ9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syde1Q9DBZ9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syde1Q9DBZ9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syde1Q9DBZ9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syde1Q9DBZ9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syde1Q9DBZ9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syde1Q9DBZ9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syde1Q9DBZ9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syde1Q9DBZ9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syde1Q9DBZ9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syde1Q9DBZ9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syde1Q9DBZ9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syde1Q9DBZ9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syde1Q9DBZ9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Syde1Q9DBZ9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syde1Q9DBZ9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Syde1Q9DBZ9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syde1Q9DBZ9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syde1Q9DBZ9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syde1Q9DBZ9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syde1Q9DBZ9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syde1Q9DBZ9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Syde1Q9DBZ9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syde1Q9DBZ9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Syde1Q9DBZ9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syde1Q9DBZ9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syde1Q9DBZ9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Syde1Q9DBZ9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syde1Q9DBZ9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syde1Q9DBZ9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syde1Q9DBZ9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syde1Q9DBZ9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syde1Q9DBZ9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syde1Q9DBZ9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syde1Q9DBZ9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syde1Q9DBZ9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syde1Q9DBZ9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syde1Q9DBZ9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Syde1Q9DBZ9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syde1Q9DBZ9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syde1Q9DBZ9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syde1Q9DBZ9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syde1Q9DBZ9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syde1Q9DBZ9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syde1Q9DBZ9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syde1Q9DBZ9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syde1Q9DBZ9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syde1Q9DBZ9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Syde1Q9DBZ9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syde1Q9DBZ9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syde1Q9DBZ9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Syde1Q9DBZ9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syde1Q9DBZ9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syde1Q9DBZ9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syde1Q9DBZ9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syde1Q9DBZ9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syde1Q9DBZ9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syde1Q9DBZ9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syde1Q9DBZ9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syde1Q9DBZ9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syde1Q9DBZ9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syde1Q9DBZ9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syde1Q9DBZ9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syde1Q9DBZ9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syde1Q9DBZ9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syde1Q9DBZ9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syde1Q9DBZ9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syde1Q9DBZ9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syde1Q9DBZ9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syde1Q9DBZ9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syde1Q9DBZ9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syde1Q9DBZ9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syde1Q9DBZ9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syde1Q9DBZ9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syde1Q9DBZ9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syde1Q9DBZ9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syde1Q9DBZ9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syde1Q9DBZ9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms