Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBM0

Abcg8, ATP-binding cassette sub-family G member 8, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg8Q9DBM0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcg8Q9DBM0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcg8Q9DBM0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcg8Q9DBM0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcg8Q9DBM0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcg8Q9DBM0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcg8Q9DBM0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcg8Q9DBM0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcg8Q9DBM0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcg8Q9DBM0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcg8Q9DBM0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcg8Q9DBM0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcg8Q9DBM0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcg8Q9DBM0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcg8Q9DBM0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcg8Q9DBM0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcg8Q9DBM0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcg8Q9DBM0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcg8Q9DBM0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcg8Q9DBM0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcg8Q9DBM0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcg8Q9DBM0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcg8Q9DBM0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcg8Q9DBM0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcg8Q9DBM0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcg8Q9DBM0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcg8Q9DBM0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcg8Q9DBM0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcg8Q9DBM0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcg8Q9DBM0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcg8Q9DBM0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcg8Q9DBM0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcg8Q9DBM0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcg8Q9DBM0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcg8Q9DBM0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcg8Q9DBM0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcg8Q9DBM0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcg8Q9DBM0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcg8Q9DBM0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcg8Q9DBM0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcg8Q9DBM0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcg8Q9DBM0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcg8Q9DBM0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcg8Q9DBM0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcg8Q9DBM0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcg8Q9DBM0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcg8Q9DBM0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcg8Q9DBM0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcg8Q9DBM0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcg8Q9DBM0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcg8Q9DBM0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcg8Q9DBM0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcg8Q9DBM0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcg8Q9DBM0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcg8Q9DBM0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcg8Q9DBM0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcg8Q9DBM0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcg8Q9DBM0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcg8Q9DBM0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcg8Q9DBM0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcg8Q9DBM0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcg8Q9DBM0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcg8Q9DBM0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcg8Q9DBM0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcg8Q9DBM0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcg8Q9DBM0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcg8Q9DBM0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcg8Q9DBM0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcg8Q9DBM0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcg8Q9DBM0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcg8Q9DBM0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcg8Q9DBM0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcg8Q9DBM0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Abcg8Q9DBM0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcg8Q9DBM0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcg8Q9DBM0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcg8Q9DBM0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcg8Q9DBM0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcg8Q9DBM0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcg8Q9DBM0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcg8Q9DBM0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcg8Q9DBM0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcg8Q9DBM0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcg8Q9DBM0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcg8Q9DBM0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcg8Q9DBM0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcg8Q9DBM0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcg8Q9DBM0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcg8Q9DBM0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcg8Q9DBM0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcg8Q9DBM0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcg8Q9DBM0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcg8Q9DBM0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcg8Q9DBM0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcg8Q9DBM0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcg8Q9DBM0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcg8Q9DBM0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcg8Q9DBM0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcg8Q9DBM0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcg8Q9DBM0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms