Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBA9

Gtf2h1, General transcription factor IIH subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2h1Q9DBA9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2h1Q9DBA9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2h1Q9DBA9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2h1Q9DBA9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2h1Q9DBA9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2h1Q9DBA9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2h1Q9DBA9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2h1Q9DBA9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2h1Q9DBA9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2h1Q9DBA9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2h1Q9DBA9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2h1Q9DBA9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2h1Q9DBA9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2h1Q9DBA9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2h1Q9DBA9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gtf2h1Q9DBA9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2h1Q9DBA9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2h1Q9DBA9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2h1Q9DBA9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2h1Q9DBA9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2h1Q9DBA9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2h1Q9DBA9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2h1Q9DBA9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2h1Q9DBA9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2h1Q9DBA9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2h1Q9DBA9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2h1Q9DBA9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2h1Q9DBA9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2h1Q9DBA9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2h1Q9DBA9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2h1Q9DBA9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2h1Q9DBA9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2h1Q9DBA9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2h1Q9DBA9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2h1Q9DBA9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2h1Q9DBA9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2h1Q9DBA9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2h1Q9DBA9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2h1Q9DBA9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2h1Q9DBA9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2h1Q9DBA9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2h1Q9DBA9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2h1Q9DBA9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2h1Q9DBA9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2h1Q9DBA9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2h1Q9DBA9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2h1Q9DBA9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2h1Q9DBA9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2h1Q9DBA9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2h1Q9DBA9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2h1Q9DBA9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2h1Q9DBA9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2h1Q9DBA9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2h1Q9DBA9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2h1Q9DBA9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2h1Q9DBA9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2h1Q9DBA9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2h1Q9DBA9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2h1Q9DBA9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2h1Q9DBA9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2h1Q9DBA9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2h1Q9DBA9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2h1Q9DBA9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2h1Q9DBA9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2h1Q9DBA9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2h1Q9DBA9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2h1Q9DBA9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2h1Q9DBA9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2h1Q9DBA9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2h1Q9DBA9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2h1Q9DBA9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2h1Q9DBA9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2h1Q9DBA9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2h1Q9DBA9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2h1Q9DBA9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2h1Q9DBA9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2h1Q9DBA9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2h1Q9DBA9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2h1Q9DBA9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2h1Q9DBA9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2h1Q9DBA9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2h1Q9DBA9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2h1Q9DBA9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2h1Q9DBA9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2h1Q9DBA9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2h1Q9DBA9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2h1Q9DBA9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2h1Q9DBA9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2h1Q9DBA9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2h1Q9DBA9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2h1Q9DBA9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf2h1Q9DBA9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf2h1Q9DBA9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf2h1Q9DBA9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2h1Q9DBA9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2h1Q9DBA9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2h1Q9DBA9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2h1Q9DBA9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2h1Q9DBA9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2h1Q9DBA9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms