Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smg9Q9DB90 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smg9Q9DB90 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smg9Q9DB90 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smg9Q9DB90 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smg9Q9DB90 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smg9Q9DB90 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smg9Q9DB90 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smg9Q9DB90 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smg9Q9DB90 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smg9Q9DB90 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smg9Q9DB90 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smg9Q9DB90 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smg9Q9DB90 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smg9Q9DB90 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smg9Q9DB90 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smg9Q9DB90 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smg9Q9DB90 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smg9Q9DB90 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smg9Q9DB90 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smg9Q9DB90 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smg9Q9DB90 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smg9Q9DB90 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smg9Q9DB90 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smg9Q9DB90 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smg9Q9DB90 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smg9Q9DB90 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Smg9Q9DB90 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smg9Q9DB90 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smg9Q9DB90 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smg9Q9DB90 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Smg9Q9DB90 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smg9Q9DB90 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smg9Q9DB90 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smg9Q9DB90 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smg9Q9DB90 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smg9Q9DB90 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smg9Q9DB90 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smg9Q9DB90 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smg9Q9DB90 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smg9Q9DB90 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smg9Q9DB90 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smg9Q9DB90 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smg9Q9DB90 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg9Q9DB90 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg9Q9DB90 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg9Q9DB90 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg9Q9DB90 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg9Q9DB90 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg9Q9DB90 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smg9Q9DB90 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smg9Q9DB90 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smg9Q9DB90 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Smg9Q9DB90 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smg9Q9DB90 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Smg9Q9DB90 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smg9Q9DB90 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smg9Q9DB90 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smg9Q9DB90 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smg9Q9DB90 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smg9Q9DB90 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smg9Q9DB90 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smg9Q9DB90 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smg9Q9DB90 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smg9Q9DB90 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smg9Q9DB90 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smg9Q9DB90 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smg9Q9DB90 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smg9Q9DB90 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smg9Q9DB90 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smg9Q9DB90 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Smg9Q9DB90 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smg9Q9DB90 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smg9Q9DB90 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smg9Q9DB90 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smg9Q9DB90 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smg9Q9DB90 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smg9Q9DB90 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smg9Q9DB90 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Smg9Q9DB90 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smg9Q9DB90 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Smg9Q9DB90 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Smg9Q9DB90 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smg9Q9DB90 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smg9Q9DB90 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smg9Q9DB90 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smg9Q9DB90 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smg9Q9DB90 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Smg9Q9DB90 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smg9Q9DB90 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smg9Q9DB90 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smg9Q9DB90 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg9Q9DB90 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg9Q9DB90 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg9Q9DB90 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg9Q9DB90 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg9Q9DB90 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg9Q9DB90 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg9Q9DB90 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg9Q9DB90 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms