Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fundc1Q9DB70 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fundc1Q9DB70 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fundc1Q9DB70 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Fundc1Q9DB70 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Fundc1Q9DB70 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fundc1Q9DB70 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fundc1Q9DB70 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fundc1Q9DB70 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fundc1Q9DB70 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fundc1Q9DB70 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fundc1Q9DB70 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fundc1Q9DB70 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fundc1Q9DB70 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fundc1Q9DB70 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fundc1Q9DB70 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fundc1Q9DB70 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fundc1Q9DB70 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fundc1Q9DB70 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fundc1Q9DB70 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fundc1Q9DB70 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fundc1Q9DB70 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fundc1Q9DB70 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fundc1Q9DB70 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fundc1Q9DB70 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fundc1Q9DB70 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fundc1Q9DB70 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fundc1Q9DB70 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fundc1Q9DB70 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fundc1Q9DB70 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fundc1Q9DB70 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fundc1Q9DB70 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fundc1Q9DB70 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fundc1Q9DB70 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fundc1Q9DB70 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fundc1Q9DB70 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fundc1Q9DB70 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fundc1Q9DB70 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Fundc1Q9DB70 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fundc1Q9DB70 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fundc1Q9DB70 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fundc1Q9DB70 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fundc1Q9DB70 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fundc1Q9DB70 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fundc1Q9DB70 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fundc1Q9DB70 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fundc1Q9DB70 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fundc1Q9DB70 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Fundc1Q9DB70 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fundc1Q9DB70 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fundc1Q9DB70 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.5 ms