Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pop5Q9DB28 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pop5Q9DB28 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pop5Q9DB28 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pop5Q9DB28 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pop5Q9DB28 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pop5Q9DB28 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pop5Q9DB28 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pop5Q9DB28 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pop5Q9DB28 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pop5Q9DB28 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pop5Q9DB28 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pop5Q9DB28 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pop5Q9DB28 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pop5Q9DB28 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pop5Q9DB28 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pop5Q9DB28 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pop5Q9DB28 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pop5Q9DB28 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pop5Q9DB28 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pop5Q9DB28 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pop5Q9DB28 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pop5Q9DB28 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pop5Q9DB28 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pop5Q9DB28 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pop5Q9DB28 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pop5Q9DB28 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pop5Q9DB28 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pop5Q9DB28 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pop5Q9DB28 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pop5Q9DB28 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pop5Q9DB28 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pop5Q9DB28 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pop5Q9DB28 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pop5Q9DB28 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pop5Q9DB28 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pop5Q9DB28 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pop5Q9DB28 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pop5Q9DB28 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pop5Q9DB28 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pop5Q9DB28 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pop5Q9DB28 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pop5Q9DB28 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Pop5Q9DB28 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pop5Q9DB28 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pop5Q9DB28 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pop5Q9DB28 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
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