Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA83

1700018B08Rik, RIKEN cDNA 1700018B08, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018B08RikQ9DA83 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
1700018B08RikQ9DA83 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
1700018B08RikQ9DA83 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
1700018B08RikQ9DA83 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
1700018B08RikQ9DA83 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
1700018B08RikQ9DA83 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
1700018B08RikQ9DA83 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
1700018B08RikQ9DA83 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
1700018B08RikQ9DA83 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
1700018B08RikQ9DA83 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
1700018B08RikQ9DA83 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
1700018B08RikQ9DA83 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
1700018B08RikQ9DA83 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
1700018B08RikQ9DA83 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
1700018B08RikQ9DA83 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
1700018B08RikQ9DA83 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
1700018B08RikQ9DA83 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
1700018B08RikQ9DA83 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
1700018B08RikQ9DA83 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
1700018B08RikQ9DA83 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
1700018B08RikQ9DA83 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
1700018B08RikQ9DA83 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
1700018B08RikQ9DA83 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
1700018B08RikQ9DA83 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
1700018B08RikQ9DA83 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
1700018B08RikQ9DA83 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
1700018B08RikQ9DA83 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
1700018B08RikQ9DA83 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
1700018B08RikQ9DA83 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
1700018B08RikQ9DA83 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
1700018B08RikQ9DA83 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
1700018B08RikQ9DA83 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
1700018B08RikQ9DA83 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
1700018B08RikQ9DA83 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
1700018B08RikQ9DA83 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
1700018B08RikQ9DA83 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
1700018B08RikQ9DA83 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
1700018B08RikQ9DA83 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
1700018B08RikQ9DA83 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
1700018B08RikQ9DA83 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
1700018B08RikQ9DA83 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
1700018B08RikQ9DA83 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
1700018B08RikQ9DA83 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
1700018B08RikQ9DA83 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
1700018B08RikQ9DA83 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
1700018B08RikQ9DA83 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
1700018B08RikQ9DA83 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
1700018B08RikQ9DA83 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
1700018B08RikQ9DA83 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
1700018B08RikQ9DA83 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
1700018B08RikQ9DA83 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
1700018B08RikQ9DA83 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
1700018B08RikQ9DA83 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
1700018B08RikQ9DA83 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
1700018B08RikQ9DA83 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
1700018B08RikQ9DA83 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
1700018B08RikQ9DA83 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
1700018B08RikQ9DA83 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
1700018B08RikQ9DA83 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
1700018B08RikQ9DA83 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
1700018B08RikQ9DA83 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
1700018B08RikQ9DA83 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
1700018B08RikQ9DA83 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
1700018B08RikQ9DA83 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
1700018B08RikQ9DA83 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
1700018B08RikQ9DA83 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
1700018B08RikQ9DA83 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
1700018B08RikQ9DA83 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
1700018B08RikQ9DA83 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
1700018B08RikQ9DA83 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
1700018B08RikQ9DA83 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
1700018B08RikQ9DA83 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
1700018B08RikQ9DA83 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
1700018B08RikQ9DA83 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
1700018B08RikQ9DA83 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
1700018B08RikQ9DA83 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
1700018B08RikQ9DA83 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
1700018B08RikQ9DA83 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
1700018B08RikQ9DA83 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
1700018B08RikQ9DA83 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
1700018B08RikQ9DA83 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
1700018B08RikQ9DA83 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
1700018B08RikQ9DA83 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
1700018B08RikQ9DA83 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
1700018B08RikQ9DA83 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
1700018B08RikQ9DA83 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
1700018B08RikQ9DA83 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
1700018B08RikQ9DA83 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
1700018B08RikQ9DA83 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
1700018B08RikQ9DA83 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
1700018B08RikQ9DA83 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
1700018B08RikQ9DA83 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
1700018B08RikQ9DA83 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
1700018B08RikQ9DA83 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
1700018B08RikQ9DA83 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
1700018B08RikQ9DA83 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
1700018B08RikQ9DA83 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
1700018B08RikQ9DA83 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
1700018B08RikQ9DA83 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
1700018B08RikQ9DA83 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms