Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T0

Fam3a, Protein FAM3A, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam3aQ9D8T0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam3aQ9D8T0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fam3aQ9D8T0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fam3aQ9D8T0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam3aQ9D8T0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam3aQ9D8T0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam3aQ9D8T0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam3aQ9D8T0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam3aQ9D8T0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam3aQ9D8T0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam3aQ9D8T0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam3aQ9D8T0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam3aQ9D8T0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam3aQ9D8T0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam3aQ9D8T0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam3aQ9D8T0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam3aQ9D8T0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam3aQ9D8T0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam3aQ9D8T0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam3aQ9D8T0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam3aQ9D8T0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam3aQ9D8T0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam3aQ9D8T0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam3aQ9D8T0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam3aQ9D8T0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam3aQ9D8T0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam3aQ9D8T0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam3aQ9D8T0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam3aQ9D8T0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam3aQ9D8T0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam3aQ9D8T0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam3aQ9D8T0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam3aQ9D8T0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam3aQ9D8T0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam3aQ9D8T0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam3aQ9D8T0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam3aQ9D8T0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam3aQ9D8T0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam3aQ9D8T0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam3aQ9D8T0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam3aQ9D8T0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam3aQ9D8T0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam3aQ9D8T0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fam3aQ9D8T0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fam3aQ9D8T0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam3aQ9D8T0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam3aQ9D8T0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam3aQ9D8T0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam3aQ9D8T0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam3aQ9D8T0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam3aQ9D8T0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam3aQ9D8T0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam3aQ9D8T0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam3aQ9D8T0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Fam3aQ9D8T0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam3aQ9D8T0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Fam3aQ9D8T0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam3aQ9D8T0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam3aQ9D8T0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam3aQ9D8T0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam3aQ9D8T0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam3aQ9D8T0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam3aQ9D8T0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam3aQ9D8T0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam3aQ9D8T0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam3aQ9D8T0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam3aQ9D8T0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam3aQ9D8T0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam3aQ9D8T0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam3aQ9D8T0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam3aQ9D8T0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam3aQ9D8T0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam3aQ9D8T0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam3aQ9D8T0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam3aQ9D8T0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam3aQ9D8T0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam3aQ9D8T0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam3aQ9D8T0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Fam3aQ9D8T0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam3aQ9D8T0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam3aQ9D8T0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam3aQ9D8T0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam3aQ9D8T0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms