Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chmp4bQ9D8B3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chmp4bQ9D8B3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chmp4bQ9D8B3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Chmp4bQ9D8B3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chmp4bQ9D8B3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chmp4bQ9D8B3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chmp4bQ9D8B3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chmp4bQ9D8B3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chmp4bQ9D8B3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chmp4bQ9D8B3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chmp4bQ9D8B3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chmp4bQ9D8B3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chmp4bQ9D8B3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chmp4bQ9D8B3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chmp4bQ9D8B3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chmp4bQ9D8B3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chmp4bQ9D8B3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chmp4bQ9D8B3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chmp4bQ9D8B3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chmp4bQ9D8B3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chmp4bQ9D8B3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chmp4bQ9D8B3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chmp4bQ9D8B3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chmp4bQ9D8B3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chmp4bQ9D8B3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chmp4bQ9D8B3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chmp4bQ9D8B3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chmp4bQ9D8B3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chmp4bQ9D8B3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chmp4bQ9D8B3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chmp4bQ9D8B3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chmp4bQ9D8B3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chmp4bQ9D8B3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chmp4bQ9D8B3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chmp4bQ9D8B3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chmp4bQ9D8B3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chmp4bQ9D8B3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chmp4bQ9D8B3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chmp4bQ9D8B3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chmp4bQ9D8B3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chmp4bQ9D8B3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chmp4bQ9D8B3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chmp4bQ9D8B3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chmp4bQ9D8B3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chmp4bQ9D8B3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chmp4bQ9D8B3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Chmp4bQ9D8B3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chmp4bQ9D8B3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Chmp4bQ9D8B3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chmp4bQ9D8B3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chmp4bQ9D8B3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chmp4bQ9D8B3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chmp4bQ9D8B3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chmp4bQ9D8B3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chmp4bQ9D8B3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chmp4bQ9D8B3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chmp4bQ9D8B3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chmp4bQ9D8B3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chmp4bQ9D8B3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chmp4bQ9D8B3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chmp4bQ9D8B3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chmp4bQ9D8B3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chmp4bQ9D8B3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Chmp4bQ9D8B3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chmp4bQ9D8B3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chmp4bQ9D8B3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chmp4bQ9D8B3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chmp4bQ9D8B3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chmp4bQ9D8B3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Chmp4bQ9D8B3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chmp4bQ9D8B3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chmp4bQ9D8B3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chmp4bQ9D8B3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chmp4bQ9D8B3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chmp4bQ9D8B3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Chmp4bQ9D8B3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Chmp4bQ9D8B3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Chmp4bQ9D8B3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Chmp4bQ9D8B3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Chmp4bQ9D8B3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chmp4bQ9D8B3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chmp4bQ9D8B3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chmp4bQ9D8B3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chmp4bQ9D8B3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chmp4bQ9D8B3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chmp4bQ9D8B3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chmp4bQ9D8B3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chmp4bQ9D8B3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chmp4bQ9D8B3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chmp4bQ9D8B3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chmp4bQ9D8B3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chmp4bQ9D8B3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chmp4bQ9D8B3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chmp4bQ9D8B3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chmp4bQ9D8B3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chmp4bQ9D8B3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chmp4bQ9D8B3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms