Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubxn11Q9D572 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubxn11Q9D572 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubxn11Q9D572 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubxn11Q9D572 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubxn11Q9D572 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubxn11Q9D572 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubxn11Q9D572 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubxn11Q9D572 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubxn11Q9D572 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubxn11Q9D572 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubxn11Q9D572 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubxn11Q9D572 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubxn11Q9D572 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubxn11Q9D572 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubxn11Q9D572 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubxn11Q9D572 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubxn11Q9D572 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubxn11Q9D572 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubxn11Q9D572 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubxn11Q9D572 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubxn11Q9D572 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubxn11Q9D572 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubxn11Q9D572 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubxn11Q9D572 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubxn11Q9D572 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubxn11Q9D572 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubxn11Q9D572 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ubxn11Q9D572 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubxn11Q9D572 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubxn11Q9D572 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubxn11Q9D572 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubxn11Q9D572 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubxn11Q9D572 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubxn11Q9D572 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubxn11Q9D572 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubxn11Q9D572 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubxn11Q9D572 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubxn11Q9D572 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubxn11Q9D572 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn11Q9D572 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn11Q9D572 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn11Q9D572 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn11Q9D572 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn11Q9D572 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn11Q9D572 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn11Q9D572 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn11Q9D572 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn11Q9D572 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ubxn11Q9D572 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ubxn11Q9D572 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ubxn11Q9D572 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ubxn11Q9D572 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubxn11Q9D572 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubxn11Q9D572 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubxn11Q9D572 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubxn11Q9D572 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubxn11Q9D572 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubxn11Q9D572 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubxn11Q9D572 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubxn11Q9D572 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubxn11Q9D572 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubxn11Q9D572 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubxn11Q9D572 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubxn11Q9D572 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubxn11Q9D572 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ubxn11Q9D572 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ubxn11Q9D572 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ubxn11Q9D572 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubxn11Q9D572 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubxn11Q9D572 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubxn11Q9D572 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubxn11Q9D572 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubxn11Q9D572 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubxn11Q9D572 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubxn11Q9D572 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubxn11Q9D572 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubxn11Q9D572 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubxn11Q9D572 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubxn11Q9D572 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubxn11Q9D572 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubxn11Q9D572 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubxn11Q9D572 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubxn11Q9D572 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubxn11Q9D572 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubxn11Q9D572 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubxn11Q9D572 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubxn11Q9D572 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubxn11Q9D572 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubxn11Q9D572 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubxn11Q9D572 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubxn11Q9D572 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubxn11Q9D572 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubxn11Q9D572 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubxn11Q9D572 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubxn11Q9D572 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubxn11Q9D572 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubxn11Q9D572 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ubxn11Q9D572 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ubxn11Q9D572 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.8 ms