Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc130Q9D516 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc130Q9D516 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ccdc130Q9D516 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc130Q9D516 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc130Q9D516 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc130Q9D516 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc130Q9D516 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc130Q9D516 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc130Q9D516 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc130Q9D516 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc130Q9D516 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc130Q9D516 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc130Q9D516 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc130Q9D516 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc130Q9D516 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc130Q9D516 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc130Q9D516 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc130Q9D516 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc130Q9D516 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc130Q9D516 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc130Q9D516 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc130Q9D516 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc130Q9D516 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc130Q9D516 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc130Q9D516 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc130Q9D516 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc130Q9D516 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc130Q9D516 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc130Q9D516 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc130Q9D516 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc130Q9D516 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc130Q9D516 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc130Q9D516 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc130Q9D516 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc130Q9D516 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc130Q9D516 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc130Q9D516 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc130Q9D516 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc130Q9D516 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc130Q9D516 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc130Q9D516 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc130Q9D516 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc130Q9D516 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc130Q9D516 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc130Q9D516 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc130Q9D516 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc130Q9D516 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc130Q9D516 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc130Q9D516 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc130Q9D516 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc130Q9D516 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc130Q9D516 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc130Q9D516 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc130Q9D516 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc130Q9D516 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc130Q9D516 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc130Q9D516 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc130Q9D516 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc130Q9D516 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc130Q9D516 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc130Q9D516 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc130Q9D516 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc130Q9D516 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc130Q9D516 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc130Q9D516 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc130Q9D516 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc130Q9D516 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc130Q9D516 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc130Q9D516 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc130Q9D516 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc130Q9D516 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc130Q9D516 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc130Q9D516 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc130Q9D516 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc130Q9D516 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc130Q9D516 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc130Q9D516 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc130Q9D516 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc130Q9D516 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc130Q9D516 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc130Q9D516 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc130Q9D516 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc130Q9D516 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc130Q9D516 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc130Q9D516 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc130Q9D516 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc130Q9D516 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc130Q9D516 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc130Q9D516 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc130Q9D516 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc130Q9D516 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc130Q9D516 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc130Q9D516 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc130Q9D516 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc130Q9D516 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc130Q9D516 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc130Q9D516 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc130Q9D516 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc130Q9D516 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms