Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3404Q9D506 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3404Q9D506 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3404Q9D506 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3404Q9D506 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3404Q9D506 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3404Q9D506 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3404Q9D506 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3404Q9D506 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3404Q9D506 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3404Q9D506 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3404Q9D506 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3404Q9D506 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3404Q9D506 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3404Q9D506 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3404Q9D506 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3404Q9D506 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3404Q9D506 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3404Q9D506 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm3404Q9D506 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm3404Q9D506 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm3404Q9D506 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm3404Q9D506 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm3404Q9D506 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm3404Q9D506 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3404Q9D506 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3404Q9D506 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3404Q9D506 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3404Q9D506 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3404Q9D506 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3404Q9D506 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3404Q9D506 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3404Q9D506 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3404Q9D506 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3404Q9D506 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3404Q9D506 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3404Q9D506 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3404Q9D506 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3404Q9D506 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3404Q9D506 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3404Q9D506 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3404Q9D506 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3404Q9D506 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3404Q9D506 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3404Q9D506 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3404Q9D506 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3404Q9D506 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3404Q9D506 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3404Q9D506 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3404Q9D506 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3404Q9D506 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3404Q9D506 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3404Q9D506 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3404Q9D506 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3404Q9D506 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3404Q9D506 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3404Q9D506 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3404Q9D506 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3404Q9D506 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3404Q9D506 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3404Q9D506 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3404Q9D506 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3404Q9D506 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3404Q9D506 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.5 ms