Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J9

4931423N10Rik, MCG52616, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931423N10RikQ9D4J9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4931423N10RikQ9D4J9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
4931423N10RikQ9D4J9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4931423N10RikQ9D4J9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4931423N10RikQ9D4J9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4931423N10RikQ9D4J9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
4931423N10RikQ9D4J9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
4931423N10RikQ9D4J9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4931423N10RikQ9D4J9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4931423N10RikQ9D4J9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4931423N10RikQ9D4J9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4931423N10RikQ9D4J9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4931423N10RikQ9D4J9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23■■□□□ 1.27
4931423N10RikQ9D4J9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4931423N10RikQ9D4J9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4931423N10RikQ9D4J9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
4931423N10RikQ9D4J9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
4931423N10RikQ9D4J9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
4931423N10RikQ9D4J9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4931423N10RikQ9D4J9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4931423N10RikQ9D4J9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4931423N10RikQ9D4J9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
4931423N10RikQ9D4J9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4931423N10RikQ9D4J9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4931423N10RikQ9D4J9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4931423N10RikQ9D4J9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4931423N10RikQ9D4J9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4931423N10RikQ9D4J9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4931423N10RikQ9D4J9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4931423N10RikQ9D4J9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
4931423N10RikQ9D4J9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4931423N10RikQ9D4J9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
4931423N10RikQ9D4J9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4931423N10RikQ9D4J9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4931423N10RikQ9D4J9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4931423N10RikQ9D4J9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
4931423N10RikQ9D4J9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4931423N10RikQ9D4J9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
4931423N10RikQ9D4J9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4931423N10RikQ9D4J9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4931423N10RikQ9D4J9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4931423N10RikQ9D4J9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4931423N10RikQ9D4J9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
4931423N10RikQ9D4J9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
4931423N10RikQ9D4J9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
4931423N10RikQ9D4J9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
4931423N10RikQ9D4J9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
4931423N10RikQ9D4J9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
4931423N10RikQ9D4J9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4931423N10RikQ9D4J9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4931423N10RikQ9D4J9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4931423N10RikQ9D4J9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
4931423N10RikQ9D4J9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4931423N10RikQ9D4J9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4931423N10RikQ9D4J9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
4931423N10RikQ9D4J9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4931423N10RikQ9D4J9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
4931423N10RikQ9D4J9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4931423N10RikQ9D4J9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
4931423N10RikQ9D4J9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
4931423N10RikQ9D4J9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
4931423N10RikQ9D4J9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4931423N10RikQ9D4J9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4931423N10RikQ9D4J9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
4931423N10RikQ9D4J9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4931423N10RikQ9D4J9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
4931423N10RikQ9D4J9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
4931423N10RikQ9D4J9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
4931423N10RikQ9D4J9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4931423N10RikQ9D4J9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
4931423N10RikQ9D4J9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4931423N10RikQ9D4J9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
4931423N10RikQ9D4J9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
4931423N10RikQ9D4J9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4931423N10RikQ9D4J9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
4931423N10RikQ9D4J9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
4931423N10RikQ9D4J9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4931423N10RikQ9D4J9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4931423N10RikQ9D4J9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
4931423N10RikQ9D4J9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4931423N10RikQ9D4J9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4931423N10RikQ9D4J9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4931423N10RikQ9D4J9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4931423N10RikQ9D4J9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4931423N10RikQ9D4J9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
4931423N10RikQ9D4J9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4931423N10RikQ9D4J9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4931423N10RikQ9D4J9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4931423N10RikQ9D4J9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4931423N10RikQ9D4J9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
4931423N10RikQ9D4J9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4931423N10RikQ9D4J9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
4931423N10RikQ9D4J9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4931423N10RikQ9D4J9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4931423N10RikQ9D4J9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4931423N10RikQ9D4J9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
4931423N10RikQ9D4J9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms