Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9D2Q3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9D2Q3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9D2Q3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9D2Q3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q9D2Q3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Q9D2Q3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Q9D2Q3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q9D2Q3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9D2Q3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9D2Q3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9D2Q3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9D2Q3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9D2Q3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9D2Q3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9D2Q3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9D2Q3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9D2Q3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9D2Q3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9D2Q3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9D2Q3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9D2Q3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9D2Q3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9D2Q3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9D2Q3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9D2Q3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9D2Q3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9D2Q3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9D2Q3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9D2Q3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9D2Q3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9D2Q3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9D2Q3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9D2Q3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9D2Q3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9D2Q3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9D2Q3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9D2Q3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9D2Q3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9D2Q3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9D2Q3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9D2Q3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9D2Q3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9D2Q3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9D2Q3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9D2Q3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9D2Q3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9D2Q3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9D2Q3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9D2Q3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9D2Q3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9D2Q3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9D2Q3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9D2Q3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9D2Q3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9D2Q3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9D2Q3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9D2Q3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9D2Q3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9D2Q3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9D2Q3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9D2Q3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9D2Q3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9D2Q3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9D2Q3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9D2Q3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q9D2Q3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q9D2Q3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q9D2Q3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Q9D2Q3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Q9D2Q3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q9D2Q3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q9D2Q3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q9D2Q3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q9D2Q3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9D2Q3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9D2Q3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9D2Q3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9D2Q3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.1 ms