Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Susd3Q9D176 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Susd3Q9D176 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Susd3Q9D176 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Susd3Q9D176 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Susd3Q9D176 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Susd3Q9D176 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Susd3Q9D176 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Susd3Q9D176 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Susd3Q9D176 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Susd3Q9D176 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Susd3Q9D176 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Susd3Q9D176 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Susd3Q9D176 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Susd3Q9D176 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Susd3Q9D176 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Susd3Q9D176 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Susd3Q9D176 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Susd3Q9D176 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Susd3Q9D176 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Susd3Q9D176 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Susd3Q9D176 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Susd3Q9D176 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Susd3Q9D176 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Susd3Q9D176 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Susd3Q9D176 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Susd3Q9D176 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Susd3Q9D176 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Susd3Q9D176 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Susd3Q9D176 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Susd3Q9D176 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Susd3Q9D176 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Susd3Q9D176 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Susd3Q9D176 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Susd3Q9D176 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Susd3Q9D176 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Susd3Q9D176 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Susd3Q9D176 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Susd3Q9D176 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Susd3Q9D176 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Susd3Q9D176 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Susd3Q9D176 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Susd3Q9D176 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Susd3Q9D176 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Susd3Q9D176 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Susd3Q9D176 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Susd3Q9D176 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Susd3Q9D176 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Susd3Q9D176 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Susd3Q9D176 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Susd3Q9D176 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Susd3Q9D176 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Susd3Q9D176 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Susd3Q9D176 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Susd3Q9D176 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Susd3Q9D176 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Susd3Q9D176 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Susd3Q9D176 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Susd3Q9D176 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Susd3Q9D176 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Susd3Q9D176 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Susd3Q9D176 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Susd3Q9D176 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Susd3Q9D176 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Susd3Q9D176 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Susd3Q9D176 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Susd3Q9D176 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Susd3Q9D176 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Susd3Q9D176 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Susd3Q9D176 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Susd3Q9D176 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Susd3Q9D176 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Susd3Q9D176 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Susd3Q9D176 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Susd3Q9D176 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Susd3Q9D176 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Susd3Q9D176 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Susd3Q9D176 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Susd3Q9D176 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Susd3Q9D176 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Susd3Q9D176 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Susd3Q9D176 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Susd3Q9D176 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Susd3Q9D176 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Susd3Q9D176 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Susd3Q9D176 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Susd3Q9D176 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Susd3Q9D176 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Susd3Q9D176 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Susd3Q9D176 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Susd3Q9D176 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Susd3Q9D176 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Susd3Q9D176 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Susd3Q9D176 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Susd3Q9D176 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Susd3Q9D176 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Susd3Q9D176 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Susd3Q9D176 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Susd3Q9D176 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Susd3Q9D176 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms