Protein–RNA interactions for Protein: Q9D162

Ccdc167, Coiled-coil domain-containing protein 167, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc167Q9D162 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc167Q9D162 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc167Q9D162 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc167Q9D162 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc167Q9D162 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc167Q9D162 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc167Q9D162 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc167Q9D162 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc167Q9D162 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc167Q9D162 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc167Q9D162 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc167Q9D162 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc167Q9D162 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc167Q9D162 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc167Q9D162 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc167Q9D162 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc167Q9D162 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc167Q9D162 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc167Q9D162 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc167Q9D162 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc167Q9D162 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc167Q9D162 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc167Q9D162 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc167Q9D162 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc167Q9D162 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc167Q9D162 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc167Q9D162 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc167Q9D162 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc167Q9D162 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc167Q9D162 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc167Q9D162 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc167Q9D162 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc167Q9D162 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc167Q9D162 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc167Q9D162 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc167Q9D162 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc167Q9D162 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc167Q9D162 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc167Q9D162 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc167Q9D162 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc167Q9D162 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc167Q9D162 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc167Q9D162 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc167Q9D162 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc167Q9D162 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc167Q9D162 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc167Q9D162 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc167Q9D162 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc167Q9D162 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc167Q9D162 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc167Q9D162 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc167Q9D162 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc167Q9D162 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc167Q9D162 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc167Q9D162 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc167Q9D162 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc167Q9D162 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc167Q9D162 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc167Q9D162 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc167Q9D162 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc167Q9D162 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc167Q9D162 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc167Q9D162 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc167Q9D162 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc167Q9D162 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc167Q9D162 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc167Q9D162 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc167Q9D162 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc167Q9D162 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc167Q9D162 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc167Q9D162 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc167Q9D162 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc167Q9D162 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc167Q9D162 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc167Q9D162 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc167Q9D162 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc167Q9D162 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc167Q9D162 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc167Q9D162 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc167Q9D162 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc167Q9D162 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc167Q9D162 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc167Q9D162 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc167Q9D162 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc167Q9D162 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc167Q9D162 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc167Q9D162 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc167Q9D162 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc167Q9D162 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc167Q9D162 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc167Q9D162 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc167Q9D162 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc167Q9D162 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc167Q9D162 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc167Q9D162 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc167Q9D162 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc167Q9D162 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc167Q9D162 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc167Q9D162 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc167Q9D162 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms