Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RpainQ9CWY9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RpainQ9CWY9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RpainQ9CWY9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RpainQ9CWY9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RpainQ9CWY9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RpainQ9CWY9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RpainQ9CWY9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RpainQ9CWY9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RpainQ9CWY9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RpainQ9CWY9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RpainQ9CWY9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RpainQ9CWY9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RpainQ9CWY9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RpainQ9CWY9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RpainQ9CWY9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RpainQ9CWY9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RpainQ9CWY9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RpainQ9CWY9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RpainQ9CWY9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RpainQ9CWY9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RpainQ9CWY9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RpainQ9CWY9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RpainQ9CWY9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RpainQ9CWY9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RpainQ9CWY9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RpainQ9CWY9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RpainQ9CWY9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RpainQ9CWY9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RpainQ9CWY9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RpainQ9CWY9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RpainQ9CWY9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RpainQ9CWY9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RpainQ9CWY9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RpainQ9CWY9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RpainQ9CWY9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RpainQ9CWY9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RpainQ9CWY9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RpainQ9CWY9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RpainQ9CWY9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RpainQ9CWY9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RpainQ9CWY9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RpainQ9CWY9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RpainQ9CWY9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RpainQ9CWY9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RpainQ9CWY9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RpainQ9CWY9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RpainQ9CWY9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RpainQ9CWY9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RpainQ9CWY9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RpainQ9CWY9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RpainQ9CWY9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RpainQ9CWY9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RpainQ9CWY9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RpainQ9CWY9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RpainQ9CWY9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RpainQ9CWY9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RpainQ9CWY9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RpainQ9CWY9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RpainQ9CWY9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RpainQ9CWY9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RpainQ9CWY9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RpainQ9CWY9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RpainQ9CWY9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RpainQ9CWY9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RpainQ9CWY9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RpainQ9CWY9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RpainQ9CWY9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RpainQ9CWY9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RpainQ9CWY9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RpainQ9CWY9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RpainQ9CWY9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RpainQ9CWY9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RpainQ9CWY9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RpainQ9CWY9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RpainQ9CWY9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RpainQ9CWY9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RpainQ9CWY9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RpainQ9CWY9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RpainQ9CWY9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RpainQ9CWY9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RpainQ9CWY9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RpainQ9CWY9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RpainQ9CWY9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RpainQ9CWY9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RpainQ9CWY9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RpainQ9CWY9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RpainQ9CWY9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RpainQ9CWY9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RpainQ9CWY9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RpainQ9CWY9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RpainQ9CWY9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RpainQ9CWY9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RpainQ9CWY9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RpainQ9CWY9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RpainQ9CWY9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RpainQ9CWY9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RpainQ9CWY9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RpainQ9CWY9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RpainQ9CWY9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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