Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR08

Pop4, Ribonuclease P protein subunit p29, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop4Q9CR08 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pop4Q9CR08 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pop4Q9CR08 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pop4Q9CR08 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pop4Q9CR08 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pop4Q9CR08 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pop4Q9CR08 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pop4Q9CR08 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Pop4Q9CR08 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pop4Q9CR08 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pop4Q9CR08 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pop4Q9CR08 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pop4Q9CR08 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pop4Q9CR08 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pop4Q9CR08 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pop4Q9CR08 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pop4Q9CR08 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pop4Q9CR08 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pop4Q9CR08 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pop4Q9CR08 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pop4Q9CR08 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pop4Q9CR08 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pop4Q9CR08 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pop4Q9CR08 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pop4Q9CR08 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pop4Q9CR08 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pop4Q9CR08 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pop4Q9CR08 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pop4Q9CR08 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pop4Q9CR08 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pop4Q9CR08 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pop4Q9CR08 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pop4Q9CR08 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pop4Q9CR08 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pop4Q9CR08 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pop4Q9CR08 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pop4Q9CR08 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pop4Q9CR08 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pop4Q9CR08 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pop4Q9CR08 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pop4Q9CR08 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pop4Q9CR08 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pop4Q9CR08 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pop4Q9CR08 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pop4Q9CR08 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pop4Q9CR08 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pop4Q9CR08 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Pop4Q9CR08 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pop4Q9CR08 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pop4Q9CR08 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pop4Q9CR08 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pop4Q9CR08 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pop4Q9CR08 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pop4Q9CR08 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pop4Q9CR08 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pop4Q9CR08 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pop4Q9CR08 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pop4Q9CR08 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pop4Q9CR08 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pop4Q9CR08 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pop4Q9CR08 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pop4Q9CR08 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pop4Q9CR08 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pop4Q9CR08 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pop4Q9CR08 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pop4Q9CR08 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pop4Q9CR08 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pop4Q9CR08 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pop4Q9CR08 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pop4Q9CR08 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pop4Q9CR08 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pop4Q9CR08 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pop4Q9CR08 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pop4Q9CR08 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pop4Q9CR08 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pop4Q9CR08 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pop4Q9CR08 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pop4Q9CR08 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pop4Q9CR08 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pop4Q9CR08 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pop4Q9CR08 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pop4Q9CR08 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pop4Q9CR08 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pop4Q9CR08 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pop4Q9CR08 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pop4Q9CR08 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pop4Q9CR08 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pop4Q9CR08 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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