Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed6Q9CQG0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed6Q9CQG0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed6Q9CQG0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmed6Q9CQG0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed6Q9CQG0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed6Q9CQG0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed6Q9CQG0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed6Q9CQG0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed6Q9CQG0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmed6Q9CQG0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed6Q9CQG0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms