Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpa3Q9CQ71 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpa3Q9CQ71 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpa3Q9CQ71 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpa3Q9CQ71 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpa3Q9CQ71 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpa3Q9CQ71 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpa3Q9CQ71 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpa3Q9CQ71 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpa3Q9CQ71 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpa3Q9CQ71 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpa3Q9CQ71 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpa3Q9CQ71 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpa3Q9CQ71 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpa3Q9CQ71 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpa3Q9CQ71 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpa3Q9CQ71 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpa3Q9CQ71 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpa3Q9CQ71 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpa3Q9CQ71 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpa3Q9CQ71 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpa3Q9CQ71 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpa3Q9CQ71 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpa3Q9CQ71 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpa3Q9CQ71 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpa3Q9CQ71 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpa3Q9CQ71 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpa3Q9CQ71 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpa3Q9CQ71 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpa3Q9CQ71 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpa3Q9CQ71 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpa3Q9CQ71 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpa3Q9CQ71 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpa3Q9CQ71 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpa3Q9CQ71 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpa3Q9CQ71 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpa3Q9CQ71 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpa3Q9CQ71 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpa3Q9CQ71 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpa3Q9CQ71 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpa3Q9CQ71 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpa3Q9CQ71 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpa3Q9CQ71 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpa3Q9CQ71 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpa3Q9CQ71 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpa3Q9CQ71 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpa3Q9CQ71 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpa3Q9CQ71 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpa3Q9CQ71 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpa3Q9CQ71 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpa3Q9CQ71 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpa3Q9CQ71 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpa3Q9CQ71 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpa3Q9CQ71 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpa3Q9CQ71 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpa3Q9CQ71 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpa3Q9CQ71 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpa3Q9CQ71 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpa3Q9CQ71 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpa3Q9CQ71 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpa3Q9CQ71 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpa3Q9CQ71 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpa3Q9CQ71 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpa3Q9CQ71 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpa3Q9CQ71 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpa3Q9CQ71 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpa3Q9CQ71 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpa3Q9CQ71 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpa3Q9CQ71 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpa3Q9CQ71 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpa3Q9CQ71 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpa3Q9CQ71 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpa3Q9CQ71 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpa3Q9CQ71 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpa3Q9CQ71 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpa3Q9CQ71 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpa3Q9CQ71 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpa3Q9CQ71 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpa3Q9CQ71 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpa3Q9CQ71 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpa3Q9CQ71 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpa3Q9CQ71 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpa3Q9CQ71 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpa3Q9CQ71 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpa3Q9CQ71 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpa3Q9CQ71 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpa3Q9CQ71 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpa3Q9CQ71 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rpa3Q9CQ71 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpa3Q9CQ71 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpa3Q9CQ71 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpa3Q9CQ71 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpa3Q9CQ71 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpa3Q9CQ71 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpa3Q9CQ71 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpa3Q9CQ71 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpa3Q9CQ71 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpa3Q9CQ71 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpa3Q9CQ71 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpa3Q9CQ71 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms