Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a4dQ99N05 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a4dQ99N05 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a4dQ99N05 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a4dQ99N05 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a4dQ99N05 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a4dQ99N05 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a4dQ99N05 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a4dQ99N05 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ms4a4dQ99N05 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ms4a4dQ99N05 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ms4a4dQ99N05 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ms4a4dQ99N05 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ms4a4dQ99N05 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ms4a4dQ99N05 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ms4a4dQ99N05 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a4dQ99N05 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a4dQ99N05 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a4dQ99N05 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a4dQ99N05 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a4dQ99N05 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a4dQ99N05 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a4dQ99N05 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a4dQ99N05 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a4dQ99N05 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a4dQ99N05 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a4dQ99N05 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a4dQ99N05 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a4dQ99N05 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a4dQ99N05 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a4dQ99N05 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a4dQ99N05 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a4dQ99N05 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a4dQ99N05 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a4dQ99N05 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a4dQ99N05 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a4dQ99N05 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a4dQ99N05 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a4dQ99N05 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a4dQ99N05 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a4dQ99N05 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a4dQ99N05 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a4dQ99N05 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a4dQ99N05 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a4dQ99N05 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a4dQ99N05 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a4dQ99N05 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a4dQ99N05 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a4dQ99N05 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a4dQ99N05 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a4dQ99N05 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a4dQ99N05 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a4dQ99N05 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a4dQ99N05 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a4dQ99N05 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a4dQ99N05 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a4dQ99N05 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a4dQ99N05 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a4dQ99N05 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a4dQ99N05 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a4dQ99N05 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a4dQ99N05 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a4dQ99N05 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a4dQ99N05 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a4dQ99N05 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ms4a4dQ99N05 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a4dQ99N05 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a4dQ99N05 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a4dQ99N05 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a4dQ99N05 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a4dQ99N05 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a4dQ99N05 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a4dQ99N05 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a4dQ99N05 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a4dQ99N05 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a4dQ99N05 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a4dQ99N05 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a4dQ99N05 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a4dQ99N05 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a4dQ99N05 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a4dQ99N05 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a4dQ99N05 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a4dQ99N05 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a4dQ99N05 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a4dQ99N05 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a4dQ99N05 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a4dQ99N05 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a4dQ99N05 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a4dQ99N05 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a4dQ99N05 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a4dQ99N05 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a4dQ99N05 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a4dQ99N05 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a4dQ99N05 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a4dQ99N05 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a4dQ99N05 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a4dQ99N05 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a4dQ99N05 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a4dQ99N05 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a4dQ99N05 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms