Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU8

Uncharacterized protein C6orf62 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99LU8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q99LU8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q99LU8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q99LU8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q99LU8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Q99LU8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q99LU8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q99LU8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q99LU8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q99LU8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q99LU8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q99LU8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q99LU8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q99LU8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q99LU8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q99LU8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q99LU8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q99LU8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q99LU8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q99LU8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q99LU8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q99LU8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q99LU8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q99LU8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q99LU8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q99LU8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q99LU8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q99LU8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q99LU8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q99LU8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Q99LU8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q99LU8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q99LU8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q99LU8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q99LU8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q99LU8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Q99LU8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q99LU8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q99LU8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q99LU8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q99LU8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Q99LU8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q99LU8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q99LU8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q99LU8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q99LU8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Q99LU8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q99LU8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q99LU8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q99LU8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Q99LU8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q99LU8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q99LU8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q99LU8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q99LU8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q99LU8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q99LU8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q99LU8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q99LU8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q99LU8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q99LU8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q99LU8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q99LU8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q99LU8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q99LU8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q99LU8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Q99LU8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q99LU8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q99LU8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q99LU8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Q99LU8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q99LU8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q99LU8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q99LU8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q99LU8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q99LU8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q99LU8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q99LU8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q99LU8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q99LU8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q99LU8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q99LU8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q99LU8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q99LU8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q99LU8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q99LU8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q99LU8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q99LU8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q99LU8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q99LU8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q99LU8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q99LU8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q99LU8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q99LU8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q99LU8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q99LU8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q99LU8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q99LU8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q99LU8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q99LU8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms