Protein–RNA interactions for Protein: Q99JI4

Psmd6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd6Q99JI4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psmd6Q99JI4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Psmd6Q99JI4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psmd6Q99JI4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psmd6Q99JI4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmd6Q99JI4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmd6Q99JI4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmd6Q99JI4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmd6Q99JI4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmd6Q99JI4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmd6Q99JI4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmd6Q99JI4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmd6Q99JI4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmd6Q99JI4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmd6Q99JI4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmd6Q99JI4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmd6Q99JI4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmd6Q99JI4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmd6Q99JI4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmd6Q99JI4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmd6Q99JI4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmd6Q99JI4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmd6Q99JI4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmd6Q99JI4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmd6Q99JI4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psmd6Q99JI4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psmd6Q99JI4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psmd6Q99JI4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psmd6Q99JI4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Psmd6Q99JI4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psmd6Q99JI4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmd6Q99JI4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmd6Q99JI4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmd6Q99JI4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmd6Q99JI4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmd6Q99JI4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmd6Q99JI4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmd6Q99JI4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psmd6Q99JI4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psmd6Q99JI4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psmd6Q99JI4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psmd6Q99JI4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psmd6Q99JI4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmd6Q99JI4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmd6Q99JI4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmd6Q99JI4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmd6Q99JI4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmd6Q99JI4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmd6Q99JI4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmd6Q99JI4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmd6Q99JI4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmd6Q99JI4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmd6Q99JI4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Psmd6Q99JI4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psmd6Q99JI4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psmd6Q99JI4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmd6Q99JI4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmd6Q99JI4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmd6Q99JI4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmd6Q99JI4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmd6Q99JI4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmd6Q99JI4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmd6Q99JI4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmd6Q99JI4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmd6Q99JI4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmd6Q99JI4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmd6Q99JI4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmd6Q99JI4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmd6Q99JI4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmd6Q99JI4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmd6Q99JI4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmd6Q99JI4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmd6Q99JI4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmd6Q99JI4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmd6Q99JI4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmd6Q99JI4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmd6Q99JI4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmd6Q99JI4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmd6Q99JI4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmd6Q99JI4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmd6Q99JI4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmd6Q99JI4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmd6Q99JI4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmd6Q99JI4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmd6Q99JI4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmd6Q99JI4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmd6Q99JI4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmd6Q99JI4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmd6Q99JI4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmd6Q99JI4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmd6Q99JI4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmd6Q99JI4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmd6Q99JI4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmd6Q99JI4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmd6Q99JI4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmd6Q99JI4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmd6Q99JI4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmd6Q99JI4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmd6Q99JI4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmd6Q99JI4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms