Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smarca5Q91ZW3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smarca5Q91ZW3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smarca5Q91ZW3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smarca5Q91ZW3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smarca5Q91ZW3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Smarca5Q91ZW3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Smarca5Q91ZW3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Smarca5Q91ZW3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Smarca5Q91ZW3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Smarca5Q91ZW3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Smarca5Q91ZW3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Smarca5Q91ZW3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smarca5Q91ZW3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smarca5Q91ZW3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smarca5Q91ZW3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smarca5Q91ZW3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smarca5Q91ZW3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smarca5Q91ZW3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smarca5Q91ZW3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smarca5Q91ZW3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smarca5Q91ZW3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smarca5Q91ZW3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smarca5Q91ZW3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smarca5Q91ZW3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smarca5Q91ZW3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smarca5Q91ZW3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smarca5Q91ZW3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smarca5Q91ZW3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smarca5Q91ZW3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smarca5Q91ZW3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smarca5Q91ZW3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarca5Q91ZW3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarca5Q91ZW3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarca5Q91ZW3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarca5Q91ZW3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Smarca5Q91ZW3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Smarca5Q91ZW3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Smarca5Q91ZW3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Smarca5Q91ZW3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Smarca5Q91ZW3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Smarca5Q91ZW3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Smarca5Q91ZW3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smarca5Q91ZW3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smarca5Q91ZW3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smarca5Q91ZW3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smarca5Q91ZW3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Smarca5Q91ZW3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smarca5Q91ZW3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smarca5Q91ZW3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smarca5Q91ZW3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smarca5Q91ZW3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smarca5Q91ZW3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smarca5Q91ZW3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Smarca5Q91ZW3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smarca5Q91ZW3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Smarca5Q91ZW3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarca5Q91ZW3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarca5Q91ZW3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarca5Q91ZW3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarca5Q91ZW3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarca5Q91ZW3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarca5Q91ZW3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarca5Q91ZW3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarca5Q91ZW3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smarca5Q91ZW3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smarca5Q91ZW3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smarca5Q91ZW3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smarca5Q91ZW3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smarca5Q91ZW3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smarca5Q91ZW3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Smarca5Q91ZW3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Smarca5Q91ZW3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Smarca5Q91ZW3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Smarca5Q91ZW3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smarca5Q91ZW3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Smarca5Q91ZW3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smarca5Q91ZW3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smarca5Q91ZW3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Smarca5Q91ZW3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarca5Q91ZW3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarca5Q91ZW3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarca5Q91ZW3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarca5Q91ZW3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarca5Q91ZW3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarca5Q91ZW3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarca5Q91ZW3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarca5Q91ZW3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarca5Q91ZW3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smarca5Q91ZW3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smarca5Q91ZW3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smarca5Q91ZW3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Smarca5Q91ZW3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smarca5Q91ZW3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smarca5Q91ZW3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smarca5Q91ZW3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smarca5Q91ZW3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smarca5Q91ZW3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smarca5Q91ZW3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smarca5Q91ZW3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms