Protein–RNA interactions for Protein: Q91WG3

Trub2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Trub2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trub2Q91WG3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trub2Q91WG3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trub2Q91WG3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trub2Q91WG3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trub2Q91WG3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trub2Q91WG3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trub2Q91WG3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trub2Q91WG3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trub2Q91WG3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trub2Q91WG3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Trub2Q91WG3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trub2Q91WG3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trub2Q91WG3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trub2Q91WG3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trub2Q91WG3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trub2Q91WG3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trub2Q91WG3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trub2Q91WG3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trub2Q91WG3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trub2Q91WG3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trub2Q91WG3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trub2Q91WG3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trub2Q91WG3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trub2Q91WG3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trub2Q91WG3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trub2Q91WG3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trub2Q91WG3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trub2Q91WG3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trub2Q91WG3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trub2Q91WG3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Trub2Q91WG3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trub2Q91WG3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trub2Q91WG3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trub2Q91WG3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trub2Q91WG3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trub2Q91WG3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trub2Q91WG3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trub2Q91WG3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trub2Q91WG3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trub2Q91WG3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trub2Q91WG3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trub2Q91WG3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trub2Q91WG3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trub2Q91WG3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trub2Q91WG3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trub2Q91WG3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trub2Q91WG3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trub2Q91WG3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trub2Q91WG3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trub2Q91WG3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trub2Q91WG3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trub2Q91WG3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trub2Q91WG3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trub2Q91WG3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trub2Q91WG3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trub2Q91WG3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trub2Q91WG3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trub2Q91WG3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Trub2Q91WG3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trub2Q91WG3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trub2Q91WG3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trub2Q91WG3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trub2Q91WG3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Trub2Q91WG3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trub2Q91WG3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Trub2Q91WG3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trub2Q91WG3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trub2Q91WG3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trub2Q91WG3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trub2Q91WG3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trub2Q91WG3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trub2Q91WG3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trub2Q91WG3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trub2Q91WG3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trub2Q91WG3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trub2Q91WG3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trub2Q91WG3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trub2Q91WG3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trub2Q91WG3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Trub2Q91WG3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trub2Q91WG3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trub2Q91WG3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trub2Q91WG3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Trub2Q91WG3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trub2Q91WG3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trub2Q91WG3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trub2Q91WG3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trub2Q91WG3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trub2Q91WG3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trub2Q91WG3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trub2Q91WG3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trub2Q91WG3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trub2Q91WG3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trub2Q91WG3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trub2Q91WG3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trub2Q91WG3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trub2Q91WG3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trub2Q91WG3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trub2Q91WG3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trub2Q91WG3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms