Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW4

Cacng5, Voltage-dependent calcium channel gamma-5 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng5Q8VHW4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacng5Q8VHW4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacng5Q8VHW4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacng5Q8VHW4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacng5Q8VHW4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacng5Q8VHW4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacng5Q8VHW4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacng5Q8VHW4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacng5Q8VHW4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacng5Q8VHW4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacng5Q8VHW4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacng5Q8VHW4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacng5Q8VHW4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacng5Q8VHW4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacng5Q8VHW4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacng5Q8VHW4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacng5Q8VHW4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacng5Q8VHW4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacng5Q8VHW4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacng5Q8VHW4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacng5Q8VHW4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacng5Q8VHW4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacng5Q8VHW4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacng5Q8VHW4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacng5Q8VHW4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacng5Q8VHW4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cacng5Q8VHW4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cacng5Q8VHW4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cacng5Q8VHW4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cacng5Q8VHW4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cacng5Q8VHW4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacng5Q8VHW4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacng5Q8VHW4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacng5Q8VHW4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacng5Q8VHW4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacng5Q8VHW4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacng5Q8VHW4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacng5Q8VHW4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacng5Q8VHW4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacng5Q8VHW4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacng5Q8VHW4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacng5Q8VHW4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacng5Q8VHW4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacng5Q8VHW4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacng5Q8VHW4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacng5Q8VHW4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacng5Q8VHW4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacng5Q8VHW4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacng5Q8VHW4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacng5Q8VHW4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacng5Q8VHW4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacng5Q8VHW4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacng5Q8VHW4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacng5Q8VHW4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacng5Q8VHW4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacng5Q8VHW4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacng5Q8VHW4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacng5Q8VHW4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacng5Q8VHW4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacng5Q8VHW4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacng5Q8VHW4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacng5Q8VHW4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacng5Q8VHW4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacng5Q8VHW4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacng5Q8VHW4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacng5Q8VHW4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacng5Q8VHW4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacng5Q8VHW4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacng5Q8VHW4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacng5Q8VHW4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacng5Q8VHW4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacng5Q8VHW4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacng5Q8VHW4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacng5Q8VHW4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacng5Q8VHW4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacng5Q8VHW4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacng5Q8VHW4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacng5Q8VHW4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacng5Q8VHW4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cacng5Q8VHW4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacng5Q8VHW4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacng5Q8VHW4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacng5Q8VHW4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacng5Q8VHW4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacng5Q8VHW4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacng5Q8VHW4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacng5Q8VHW4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacng5Q8VHW4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacng5Q8VHW4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacng5Q8VHW4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacng5Q8VHW4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacng5Q8VHW4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacng5Q8VHW4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacng5Q8VHW4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacng5Q8VHW4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacng5Q8VHW4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacng5Q8VHW4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacng5Q8VHW4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacng5Q8VHW4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacng5Q8VHW4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms