Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEF1

Gramd1a, GRAM domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd1aQ8VEF1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gramd1aQ8VEF1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gramd1aQ8VEF1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gramd1aQ8VEF1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gramd1aQ8VEF1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gramd1aQ8VEF1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gramd1aQ8VEF1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gramd1aQ8VEF1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gramd1aQ8VEF1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gramd1aQ8VEF1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gramd1aQ8VEF1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gramd1aQ8VEF1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gramd1aQ8VEF1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gramd1aQ8VEF1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gramd1aQ8VEF1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gramd1aQ8VEF1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gramd1aQ8VEF1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gramd1aQ8VEF1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gramd1aQ8VEF1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gramd1aQ8VEF1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gramd1aQ8VEF1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gramd1aQ8VEF1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gramd1aQ8VEF1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gramd1aQ8VEF1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gramd1aQ8VEF1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gramd1aQ8VEF1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gramd1aQ8VEF1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gramd1aQ8VEF1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gramd1aQ8VEF1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gramd1aQ8VEF1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gramd1aQ8VEF1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gramd1aQ8VEF1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gramd1aQ8VEF1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gramd1aQ8VEF1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gramd1aQ8VEF1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gramd1aQ8VEF1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gramd1aQ8VEF1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gramd1aQ8VEF1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gramd1aQ8VEF1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gramd1aQ8VEF1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gramd1aQ8VEF1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gramd1aQ8VEF1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gramd1aQ8VEF1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gramd1aQ8VEF1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms