Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubxn4Q8VCH8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubxn4Q8VCH8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubxn4Q8VCH8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubxn4Q8VCH8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubxn4Q8VCH8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubxn4Q8VCH8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubxn4Q8VCH8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubxn4Q8VCH8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubxn4Q8VCH8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubxn4Q8VCH8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubxn4Q8VCH8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubxn4Q8VCH8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubxn4Q8VCH8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubxn4Q8VCH8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubxn4Q8VCH8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubxn4Q8VCH8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubxn4Q8VCH8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubxn4Q8VCH8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ubxn4Q8VCH8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubxn4Q8VCH8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubxn4Q8VCH8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubxn4Q8VCH8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubxn4Q8VCH8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubxn4Q8VCH8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubxn4Q8VCH8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubxn4Q8VCH8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubxn4Q8VCH8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubxn4Q8VCH8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubxn4Q8VCH8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn4Q8VCH8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn4Q8VCH8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn4Q8VCH8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn4Q8VCH8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn4Q8VCH8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ubxn4Q8VCH8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ubxn4Q8VCH8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ubxn4Q8VCH8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ubxn4Q8VCH8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ubxn4Q8VCH8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ubxn4Q8VCH8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubxn4Q8VCH8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubxn4Q8VCH8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubxn4Q8VCH8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubxn4Q8VCH8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubxn4Q8VCH8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubxn4Q8VCH8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubxn4Q8VCH8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubxn4Q8VCH8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubxn4Q8VCH8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubxn4Q8VCH8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubxn4Q8VCH8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubxn4Q8VCH8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ubxn4Q8VCH8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ubxn4Q8VCH8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ubxn4Q8VCH8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ubxn4Q8VCH8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ubxn4Q8VCH8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ubxn4Q8VCH8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ubxn4Q8VCH8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ubxn4Q8VCH8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ubxn4Q8VCH8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubxn4Q8VCH8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubxn4Q8VCH8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubxn4Q8VCH8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubxn4Q8VCH8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubxn4Q8VCH8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubxn4Q8VCH8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubxn4Q8VCH8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubxn4Q8VCH8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubxn4Q8VCH8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubxn4Q8VCH8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubxn4Q8VCH8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubxn4Q8VCH8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubxn4Q8VCH8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubxn4Q8VCH8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubxn4Q8VCH8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubxn4Q8VCH8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubxn4Q8VCH8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubxn4Q8VCH8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubxn4Q8VCH8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubxn4Q8VCH8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubxn4Q8VCH8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubxn4Q8VCH8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubxn4Q8VCH8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubxn4Q8VCH8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubxn4Q8VCH8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubxn4Q8VCH8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubxn4Q8VCH8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubxn4Q8VCH8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubxn4Q8VCH8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubxn4Q8VCH8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubxn4Q8VCH8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1418.1 ms