Protein–RNA interactions for Protein: Q8R574

Prpsap2, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap2Q8R574 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpsap2Q8R574 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpsap2Q8R574 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpsap2Q8R574 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpsap2Q8R574 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpsap2Q8R574 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpsap2Q8R574 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpsap2Q8R574 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpsap2Q8R574 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpsap2Q8R574 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpsap2Q8R574 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpsap2Q8R574 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prpsap2Q8R574 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpsap2Q8R574 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpsap2Q8R574 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpsap2Q8R574 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpsap2Q8R574 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpsap2Q8R574 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpsap2Q8R574 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpsap2Q8R574 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpsap2Q8R574 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpsap2Q8R574 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpsap2Q8R574 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpsap2Q8R574 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpsap2Q8R574 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpsap2Q8R574 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpsap2Q8R574 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpsap2Q8R574 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpsap2Q8R574 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpsap2Q8R574 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpsap2Q8R574 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpsap2Q8R574 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpsap2Q8R574 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpsap2Q8R574 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpsap2Q8R574 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpsap2Q8R574 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpsap2Q8R574 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpsap2Q8R574 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpsap2Q8R574 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpsap2Q8R574 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpsap2Q8R574 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpsap2Q8R574 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpsap2Q8R574 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpsap2Q8R574 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpsap2Q8R574 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpsap2Q8R574 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpsap2Q8R574 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpsap2Q8R574 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpsap2Q8R574 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpsap2Q8R574 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpsap2Q8R574 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpsap2Q8R574 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpsap2Q8R574 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpsap2Q8R574 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpsap2Q8R574 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpsap2Q8R574 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpsap2Q8R574 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpsap2Q8R574 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpsap2Q8R574 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpsap2Q8R574 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpsap2Q8R574 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpsap2Q8R574 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpsap2Q8R574 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpsap2Q8R574 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpsap2Q8R574 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpsap2Q8R574 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpsap2Q8R574 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpsap2Q8R574 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpsap2Q8R574 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpsap2Q8R574 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpsap2Q8R574 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpsap2Q8R574 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpsap2Q8R574 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpsap2Q8R574 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prpsap2Q8R574 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Prpsap2Q8R574 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpsap2Q8R574 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpsap2Q8R574 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpsap2Q8R574 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpsap2Q8R574 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpsap2Q8R574 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpsap2Q8R574 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpsap2Q8R574 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpsap2Q8R574 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpsap2Q8R574 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpsap2Q8R574 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpsap2Q8R574 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpsap2Q8R574 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpsap2Q8R574 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpsap2Q8R574 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpsap2Q8R574 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpsap2Q8R574 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpsap2Q8R574 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpsap2Q8R574 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpsap2Q8R574 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpsap2Q8R574 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpsap2Q8R574 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpsap2Q8R574 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpsap2Q8R574 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpsap2Q8R574 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms