Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z8

Ube2q2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q2, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q2Q8K2Z8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube2q2Q8K2Z8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube2q2Q8K2Z8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube2q2Q8K2Z8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube2q2Q8K2Z8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube2q2Q8K2Z8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube2q2Q8K2Z8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube2q2Q8K2Z8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube2q2Q8K2Z8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube2q2Q8K2Z8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube2q2Q8K2Z8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube2q2Q8K2Z8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube2q2Q8K2Z8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube2q2Q8K2Z8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube2q2Q8K2Z8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube2q2Q8K2Z8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube2q2Q8K2Z8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube2q2Q8K2Z8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube2q2Q8K2Z8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube2q2Q8K2Z8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube2q2Q8K2Z8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube2q2Q8K2Z8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube2q2Q8K2Z8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube2q2Q8K2Z8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube2q2Q8K2Z8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube2q2Q8K2Z8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube2q2Q8K2Z8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube2q2Q8K2Z8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube2q2Q8K2Z8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube2q2Q8K2Z8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ube2q2Q8K2Z8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ube2q2Q8K2Z8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ube2q2Q8K2Z8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ube2q2Q8K2Z8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube2q2Q8K2Z8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube2q2Q8K2Z8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube2q2Q8K2Z8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube2q2Q8K2Z8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube2q2Q8K2Z8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube2q2Q8K2Z8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube2q2Q8K2Z8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube2q2Q8K2Z8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube2q2Q8K2Z8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube2q2Q8K2Z8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube2q2Q8K2Z8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube2q2Q8K2Z8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube2q2Q8K2Z8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube2q2Q8K2Z8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube2q2Q8K2Z8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube2q2Q8K2Z8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube2q2Q8K2Z8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube2q2Q8K2Z8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube2q2Q8K2Z8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube2q2Q8K2Z8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube2q2Q8K2Z8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube2q2Q8K2Z8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube2q2Q8K2Z8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube2q2Q8K2Z8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube2q2Q8K2Z8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube2q2Q8K2Z8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube2q2Q8K2Z8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube2q2Q8K2Z8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube2q2Q8K2Z8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube2q2Q8K2Z8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube2q2Q8K2Z8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube2q2Q8K2Z8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube2q2Q8K2Z8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ube2q2Q8K2Z8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube2q2Q8K2Z8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube2q2Q8K2Z8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube2q2Q8K2Z8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube2q2Q8K2Z8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube2q2Q8K2Z8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube2q2Q8K2Z8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube2q2Q8K2Z8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube2q2Q8K2Z8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube2q2Q8K2Z8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube2q2Q8K2Z8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube2q2Q8K2Z8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2q2Q8K2Z8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2q2Q8K2Z8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2q2Q8K2Z8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2q2Q8K2Z8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2q2Q8K2Z8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2q2Q8K2Z8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2q2Q8K2Z8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2q2Q8K2Z8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2q2Q8K2Z8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2q2Q8K2Z8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2q2Q8K2Z8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube2q2Q8K2Z8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube2q2Q8K2Z8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube2q2Q8K2Z8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube2q2Q8K2Z8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube2q2Q8K2Z8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube2q2Q8K2Z8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube2q2Q8K2Z8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube2q2Q8K2Z8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube2q2Q8K2Z8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube2q2Q8K2Z8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms