Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X8

Gtf2h5, General transcription factor IIH subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2h5Q8K2X8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms