Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Abcf3Q8K268 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Abcf3Q8K268 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Abcf3Q8K268 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Abcf3Q8K268 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Abcf3Q8K268 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Abcf3Q8K268 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Abcf3Q8K268 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Abcf3Q8K268 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Abcf3Q8K268 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abcf3Q8K268 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abcf3Q8K268 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abcf3Q8K268 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abcf3Q8K268 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abcf3Q8K268 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abcf3Q8K268 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abcf3Q8K268 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abcf3Q8K268 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abcf3Q8K268 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abcf3Q8K268 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abcf3Q8K268 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcf3Q8K268 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcf3Q8K268 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcf3Q8K268 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcf3Q8K268 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcf3Q8K268 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcf3Q8K268 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcf3Q8K268 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcf3Q8K268 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcf3Q8K268 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcf3Q8K268 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcf3Q8K268 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcf3Q8K268 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcf3Q8K268 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcf3Q8K268 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcf3Q8K268 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcf3Q8K268 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcf3Q8K268 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcf3Q8K268 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcf3Q8K268 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcf3Q8K268 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcf3Q8K268 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcf3Q8K268 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcf3Q8K268 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcf3Q8K268 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcf3Q8K268 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcf3Q8K268 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcf3Q8K268 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcf3Q8K268 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcf3Q8K268 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcf3Q8K268 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcf3Q8K268 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Abcf3Q8K268 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Abcf3Q8K268 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Abcf3Q8K268 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Abcf3Q8K268 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcf3Q8K268 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcf3Q8K268 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcf3Q8K268 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcf3Q8K268 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcf3Q8K268 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcf3Q8K268 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcf3Q8K268 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcf3Q8K268 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcf3Q8K268 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcf3Q8K268 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcf3Q8K268 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcf3Q8K268 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcf3Q8K268 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Abcf3Q8K268 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Abcf3Q8K268 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Abcf3Q8K268 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Abcf3Q8K268 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcf3Q8K268 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcf3Q8K268 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcf3Q8K268 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcf3Q8K268 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcf3Q8K268 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcf3Q8K268 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcf3Q8K268 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcf3Q8K268 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcf3Q8K268 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcf3Q8K268 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcf3Q8K268 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcf3Q8K268 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcf3Q8K268 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcf3Q8K268 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcf3Q8K268 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcf3Q8K268 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcf3Q8K268 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcf3Q8K268 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Abcf3Q8K268 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Abcf3Q8K268 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Abcf3Q8K268 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Abcf3Q8K268 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Abcf3Q8K268 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Abcf3Q8K268 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Abcf3Q8K268 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Abcf3Q8K268 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Abcf3Q8K268 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms