Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slfn5Q8CBA2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slfn5Q8CBA2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slfn5Q8CBA2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slfn5Q8CBA2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slfn5Q8CBA2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slfn5Q8CBA2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slfn5Q8CBA2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slfn5Q8CBA2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slfn5Q8CBA2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slfn5Q8CBA2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slfn5Q8CBA2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slfn5Q8CBA2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slfn5Q8CBA2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slfn5Q8CBA2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slfn5Q8CBA2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slfn5Q8CBA2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slfn5Q8CBA2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slfn5Q8CBA2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slfn5Q8CBA2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Slfn5Q8CBA2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slfn5Q8CBA2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slfn5Q8CBA2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slfn5Q8CBA2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Slfn5Q8CBA2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slfn5Q8CBA2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slfn5Q8CBA2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slfn5Q8CBA2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slfn5Q8CBA2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slfn5Q8CBA2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slfn5Q8CBA2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slfn5Q8CBA2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Slfn5Q8CBA2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slfn5Q8CBA2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slfn5Q8CBA2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slfn5Q8CBA2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Slfn5Q8CBA2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slfn5Q8CBA2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slfn5Q8CBA2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slfn5Q8CBA2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slfn5Q8CBA2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slfn5Q8CBA2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slfn5Q8CBA2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slfn5Q8CBA2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slfn5Q8CBA2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slfn5Q8CBA2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slfn5Q8CBA2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slfn5Q8CBA2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slfn5Q8CBA2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slfn5Q8CBA2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slfn5Q8CBA2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slfn5Q8CBA2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slfn5Q8CBA2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slfn5Q8CBA2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slfn5Q8CBA2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slfn5Q8CBA2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Slfn5Q8CBA2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slfn5Q8CBA2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slfn5Q8CBA2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slfn5Q8CBA2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slfn5Q8CBA2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slfn5Q8CBA2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slfn5Q8CBA2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slfn5Q8CBA2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slfn5Q8CBA2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slfn5Q8CBA2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slfn5Q8CBA2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Slfn5Q8CBA2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slfn5Q8CBA2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slfn5Q8CBA2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Slfn5Q8CBA2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slfn5Q8CBA2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slfn5Q8CBA2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slfn5Q8CBA2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slfn5Q8CBA2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Slfn5Q8CBA2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slfn5Q8CBA2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slfn5Q8CBA2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slfn5Q8CBA2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slfn5Q8CBA2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slfn5Q8CBA2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slfn5Q8CBA2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slfn5Q8CBA2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slfn5Q8CBA2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slfn5Q8CBA2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slfn5Q8CBA2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slfn5Q8CBA2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slfn5Q8CBA2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slfn5Q8CBA2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slfn5Q8CBA2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slfn5Q8CBA2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slfn5Q8CBA2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slfn5Q8CBA2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slfn5Q8CBA2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slfn5Q8CBA2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slfn5Q8CBA2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slfn5Q8CBA2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Slfn5Q8CBA2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slfn5Q8CBA2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slfn5Q8CBA2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms