Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q8C5C9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q8C5C9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q8C5C9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q8C5C9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q8C5C9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q8C5C9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q8C5C9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q8C5C9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q8C5C9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q8C5C9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q8C5C9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q8C5C9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q8C5C9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q8C5C9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q8C5C9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q8C5C9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q8C5C9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q8C5C9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q8C5C9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q8C5C9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q8C5C9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q8C5C9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Q8C5C9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q8C5C9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q8C5C9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q8C5C9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q8C5C9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q8C5C9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q8C5C9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q8C5C9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q8C5C9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q8C5C9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q8C5C9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q8C5C9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q8C5C9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q8C5C9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Q8C5C9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Q8C5C9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Q8C5C9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Q8C5C9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q8C5C9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q8C5C9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q8C5C9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q8C5C9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q8C5C9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q8C5C9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q8C5C9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q8C5C9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q8C5C9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q8C5C9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q8C5C9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Q8C5C9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q8C5C9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q8C5C9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q8C5C9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q8C5C9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q8C5C9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q8C5C9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Q8C5C9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q8C5C9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q8C5C9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q8C5C9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q8C5C9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q8C5C9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q8C5C9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q8C5C9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q8C5C9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q8C5C9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q8C5C9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q8C5C9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q8C5C9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q8C5C9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q8C5C9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q8C5C9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q8C5C9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q8C5C9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q8C5C9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q8C5C9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q8C5C9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q8C5C9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q8C5C9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q8C5C9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q8C5C9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q8C5C9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q8C5C9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q8C5C9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q8C5C9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q8C5C9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q8C5C9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q8C5C9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q8C5C9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q8C5C9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q8C5C9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Q8C5C9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Q8C5C9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q8C5C9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q8C5C9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q8C5C9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q8C5C9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms