Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S0

Usp44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, mousemouse

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp44Q8C2S0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp44Q8C2S0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp44Q8C2S0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp44Q8C2S0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp44Q8C2S0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp44Q8C2S0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp44Q8C2S0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp44Q8C2S0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp44Q8C2S0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp44Q8C2S0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp44Q8C2S0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp44Q8C2S0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp44Q8C2S0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp44Q8C2S0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp44Q8C2S0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp44Q8C2S0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp44Q8C2S0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp44Q8C2S0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp44Q8C2S0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp44Q8C2S0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp44Q8C2S0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp44Q8C2S0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp44Q8C2S0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp44Q8C2S0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp44Q8C2S0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp44Q8C2S0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp44Q8C2S0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp44Q8C2S0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp44Q8C2S0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp44Q8C2S0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp44Q8C2S0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp44Q8C2S0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp44Q8C2S0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp44Q8C2S0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp44Q8C2S0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp44Q8C2S0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp44Q8C2S0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp44Q8C2S0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp44Q8C2S0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp44Q8C2S0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp44Q8C2S0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp44Q8C2S0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
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Usp44Q8C2S0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp44Q8C2S0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp44Q8C2S0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp44Q8C2S0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp44Q8C2S0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp44Q8C2S0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp44Q8C2S0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp44Q8C2S0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp44Q8C2S0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp44Q8C2S0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp44Q8C2S0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp44Q8C2S0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp44Q8C2S0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
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Usp44Q8C2S0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp44Q8C2S0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp44Q8C2S0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp44Q8C2S0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp44Q8C2S0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp44Q8C2S0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp44Q8C2S0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp44Q8C2S0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp44Q8C2S0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp44Q8C2S0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp44Q8C2S0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp44Q8C2S0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
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Usp44Q8C2S0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp44Q8C2S0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp44Q8C2S0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp44Q8C2S0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp44Q8C2S0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp44Q8C2S0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp44Q8C2S0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp44Q8C2S0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp44Q8C2S0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp44Q8C2S0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp44Q8C2S0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp44Q8C2S0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp44Q8C2S0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp44Q8C2S0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp44Q8C2S0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp44Q8C2S0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp44Q8C2S0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp44Q8C2S0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp44Q8C2S0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp44Q8C2S0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp44Q8C2S0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp44Q8C2S0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Usp44Q8C2S0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp44Q8C2S0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp44Q8C2S0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp44Q8C2S0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp44Q8C2S0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp44Q8C2S0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp44Q8C2S0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp44Q8C2S0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms