Protein–RNA interactions for Protein: Q8C159

Ttc22, Tetratricopeptide repeat protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc22Q8C159 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
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Ttc22Q8C159 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc22Q8C159 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc22Q8C159 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc22Q8C159 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc22Q8C159 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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Ttc22Q8C159 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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Ttc22Q8C159 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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Ttc22Q8C159 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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Ttc22Q8C159 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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Ttc22Q8C159 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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Ttc22Q8C159 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Ttc22Q8C159 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Ttc22Q8C159 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Ttc22Q8C159 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Ttc22Q8C159 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Ttc22Q8C159 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc22Q8C159 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Ttc22Q8C159 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc22Q8C159 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttc22Q8C159 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttc22Q8C159 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttc22Q8C159 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Ttc22Q8C159 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttc22Q8C159 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttc22Q8C159 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttc22Q8C159 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttc22Q8C159 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttc22Q8C159 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttc22Q8C159 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttc22Q8C159 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms