Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXX9

Ccdc169, Coiled-coil domain-containing protein 169, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc169Q8BXX9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc169Q8BXX9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc169Q8BXX9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc169Q8BXX9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc169Q8BXX9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc169Q8BXX9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc169Q8BXX9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc169Q8BXX9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc169Q8BXX9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc169Q8BXX9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc169Q8BXX9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc169Q8BXX9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc169Q8BXX9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc169Q8BXX9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc169Q8BXX9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc169Q8BXX9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc169Q8BXX9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc169Q8BXX9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc169Q8BXX9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc169Q8BXX9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc169Q8BXX9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc169Q8BXX9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc169Q8BXX9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc169Q8BXX9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc169Q8BXX9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc169Q8BXX9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc169Q8BXX9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc169Q8BXX9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc169Q8BXX9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc169Q8BXX9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc169Q8BXX9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc169Q8BXX9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc169Q8BXX9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc169Q8BXX9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc169Q8BXX9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc169Q8BXX9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc169Q8BXX9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc169Q8BXX9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc169Q8BXX9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc169Q8BXX9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc169Q8BXX9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc169Q8BXX9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc169Q8BXX9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc169Q8BXX9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc169Q8BXX9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc169Q8BXX9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc169Q8BXX9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc169Q8BXX9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc169Q8BXX9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc169Q8BXX9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc169Q8BXX9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc169Q8BXX9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc169Q8BXX9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc169Q8BXX9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc169Q8BXX9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc169Q8BXX9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc169Q8BXX9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc169Q8BXX9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc169Q8BXX9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc169Q8BXX9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc169Q8BXX9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc169Q8BXX9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc169Q8BXX9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc169Q8BXX9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc169Q8BXX9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc169Q8BXX9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc169Q8BXX9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc169Q8BXX9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc169Q8BXX9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc169Q8BXX9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc169Q8BXX9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc169Q8BXX9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc169Q8BXX9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc169Q8BXX9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc169Q8BXX9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc169Q8BXX9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc169Q8BXX9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc169Q8BXX9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc169Q8BXX9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc169Q8BXX9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc169Q8BXX9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc169Q8BXX9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc169Q8BXX9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc169Q8BXX9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc169Q8BXX9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc169Q8BXX9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc169Q8BXX9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc169Q8BXX9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc169Q8BXX9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc169Q8BXX9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc169Q8BXX9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc169Q8BXX9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc169Q8BXX9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc169Q8BXX9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc169Q8BXX9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc169Q8BXX9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc169Q8BXX9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc169Q8BXX9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc169Q8BXX9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc169Q8BXX9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms