Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXF8

Actrt3, Actin-related protein T3, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt3Q8BXF8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actrt3Q8BXF8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Actrt3Q8BXF8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Actrt3Q8BXF8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Actrt3Q8BXF8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Actrt3Q8BXF8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Actrt3Q8BXF8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Actrt3Q8BXF8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Actrt3Q8BXF8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Actrt3Q8BXF8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Actrt3Q8BXF8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Actrt3Q8BXF8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actrt3Q8BXF8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actrt3Q8BXF8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actrt3Q8BXF8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actrt3Q8BXF8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actrt3Q8BXF8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actrt3Q8BXF8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actrt3Q8BXF8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actrt3Q8BXF8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actrt3Q8BXF8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actrt3Q8BXF8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Actrt3Q8BXF8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Actrt3Q8BXF8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Actrt3Q8BXF8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Actrt3Q8BXF8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Actrt3Q8BXF8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Actrt3Q8BXF8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Actrt3Q8BXF8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Actrt3Q8BXF8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Actrt3Q8BXF8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Actrt3Q8BXF8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actrt3Q8BXF8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actrt3Q8BXF8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actrt3Q8BXF8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actrt3Q8BXF8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actrt3Q8BXF8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actrt3Q8BXF8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actrt3Q8BXF8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actrt3Q8BXF8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actrt3Q8BXF8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actrt3Q8BXF8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actrt3Q8BXF8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actrt3Q8BXF8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actrt3Q8BXF8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actrt3Q8BXF8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Actrt3Q8BXF8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Actrt3Q8BXF8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Actrt3Q8BXF8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Actrt3Q8BXF8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Actrt3Q8BXF8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Actrt3Q8BXF8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actrt3Q8BXF8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actrt3Q8BXF8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Actrt3Q8BXF8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actrt3Q8BXF8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actrt3Q8BXF8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actrt3Q8BXF8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actrt3Q8BXF8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actrt3Q8BXF8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actrt3Q8BXF8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actrt3Q8BXF8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actrt3Q8BXF8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Actrt3Q8BXF8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Actrt3Q8BXF8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Actrt3Q8BXF8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Actrt3Q8BXF8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Actrt3Q8BXF8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actrt3Q8BXF8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actrt3Q8BXF8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actrt3Q8BXF8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actrt3Q8BXF8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actrt3Q8BXF8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actrt3Q8BXF8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actrt3Q8BXF8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms