Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU7

Rccd1, RCC1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rccd1Q8BTU7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rccd1Q8BTU7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rccd1Q8BTU7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rccd1Q8BTU7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rccd1Q8BTU7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rccd1Q8BTU7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rccd1Q8BTU7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rccd1Q8BTU7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rccd1Q8BTU7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rccd1Q8BTU7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rccd1Q8BTU7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rccd1Q8BTU7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rccd1Q8BTU7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rccd1Q8BTU7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rccd1Q8BTU7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rccd1Q8BTU7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rccd1Q8BTU7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rccd1Q8BTU7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rccd1Q8BTU7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rccd1Q8BTU7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rccd1Q8BTU7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rccd1Q8BTU7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rccd1Q8BTU7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rccd1Q8BTU7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rccd1Q8BTU7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rccd1Q8BTU7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rccd1Q8BTU7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rccd1Q8BTU7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rccd1Q8BTU7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rccd1Q8BTU7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rccd1Q8BTU7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rccd1Q8BTU7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rccd1Q8BTU7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rccd1Q8BTU7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rccd1Q8BTU7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rccd1Q8BTU7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rccd1Q8BTU7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rccd1Q8BTU7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rccd1Q8BTU7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rccd1Q8BTU7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rccd1Q8BTU7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rccd1Q8BTU7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rccd1Q8BTU7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rccd1Q8BTU7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rccd1Q8BTU7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rccd1Q8BTU7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rccd1Q8BTU7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rccd1Q8BTU7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rccd1Q8BTU7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rccd1Q8BTU7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rccd1Q8BTU7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rccd1Q8BTU7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rccd1Q8BTU7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rccd1Q8BTU7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rccd1Q8BTU7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rccd1Q8BTU7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rccd1Q8BTU7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rccd1Q8BTU7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rccd1Q8BTU7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rccd1Q8BTU7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rccd1Q8BTU7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rccd1Q8BTU7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rccd1Q8BTU7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rccd1Q8BTU7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rccd1Q8BTU7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rccd1Q8BTU7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rccd1Q8BTU7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rccd1Q8BTU7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rccd1Q8BTU7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rccd1Q8BTU7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rccd1Q8BTU7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rccd1Q8BTU7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rccd1Q8BTU7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rccd1Q8BTU7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rccd1Q8BTU7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rccd1Q8BTU7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rccd1Q8BTU7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rccd1Q8BTU7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rccd1Q8BTU7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rccd1Q8BTU7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rccd1Q8BTU7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rccd1Q8BTU7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rccd1Q8BTU7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rccd1Q8BTU7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rccd1Q8BTU7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rccd1Q8BTU7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rccd1Q8BTU7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rccd1Q8BTU7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rccd1Q8BTU7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rccd1Q8BTU7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rccd1Q8BTU7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rccd1Q8BTU7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rccd1Q8BTU7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rccd1Q8BTU7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rccd1Q8BTU7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rccd1Q8BTU7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rccd1Q8BTU7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rccd1Q8BTU7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rccd1Q8BTU7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rccd1Q8BTU7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms