Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQP8

Rab11fip4, Rab11 family-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip4Q8BQP8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rab11fip4Q8BQP8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rab11fip4Q8BQP8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rab11fip4Q8BQP8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rab11fip4Q8BQP8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rab11fip4Q8BQP8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab11fip4Q8BQP8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab11fip4Q8BQP8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab11fip4Q8BQP8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab11fip4Q8BQP8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab11fip4Q8BQP8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab11fip4Q8BQP8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab11fip4Q8BQP8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab11fip4Q8BQP8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Rab11fip4Q8BQP8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rab11fip4Q8BQP8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rab11fip4Q8BQP8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rab11fip4Q8BQP8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rab11fip4Q8BQP8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rab11fip4Q8BQP8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rab11fip4Q8BQP8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rab11fip4Q8BQP8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rab11fip4Q8BQP8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rab11fip4Q8BQP8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rab11fip4Q8BQP8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rab11fip4Q8BQP8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rab11fip4Q8BQP8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rab11fip4Q8BQP8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rab11fip4Q8BQP8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rab11fip4Q8BQP8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rab11fip4Q8BQP8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rab11fip4Q8BQP8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rab11fip4Q8BQP8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rab11fip4Q8BQP8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rab11fip4Q8BQP8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rab11fip4Q8BQP8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rab11fip4Q8BQP8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab11fip4Q8BQP8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab11fip4Q8BQP8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab11fip4Q8BQP8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab11fip4Q8BQP8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab11fip4Q8BQP8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab11fip4Q8BQP8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab11fip4Q8BQP8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab11fip4Q8BQP8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab11fip4Q8BQP8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rab11fip4Q8BQP8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rab11fip4Q8BQP8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rab11fip4Q8BQP8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rab11fip4Q8BQP8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rab11fip4Q8BQP8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rab11fip4Q8BQP8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rab11fip4Q8BQP8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rab11fip4Q8BQP8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rab11fip4Q8BQP8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rab11fip4Q8BQP8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rab11fip4Q8BQP8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rab11fip4Q8BQP8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab11fip4Q8BQP8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab11fip4Q8BQP8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab11fip4Q8BQP8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab11fip4Q8BQP8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab11fip4Q8BQP8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab11fip4Q8BQP8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab11fip4Q8BQP8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab11fip4Q8BQP8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab11fip4Q8BQP8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab11fip4Q8BQP8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab11fip4Q8BQP8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab11fip4Q8BQP8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab11fip4Q8BQP8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab11fip4Q8BQP8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab11fip4Q8BQP8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab11fip4Q8BQP8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab11fip4Q8BQP8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab11fip4Q8BQP8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab11fip4Q8BQP8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab11fip4Q8BQP8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rab11fip4Q8BQP8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rab11fip4Q8BQP8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rab11fip4Q8BQP8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rab11fip4Q8BQP8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rab11fip4Q8BQP8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rab11fip4Q8BQP8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rab11fip4Q8BQP8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rab11fip4Q8BQP8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rab11fip4Q8BQP8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rab11fip4Q8BQP8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rab11fip4Q8BQP8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rab11fip4Q8BQP8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rab11fip4Q8BQP8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rab11fip4Q8BQP8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rab11fip4Q8BQP8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rab11fip4Q8BQP8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rab11fip4Q8BQP8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rab11fip4Q8BQP8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rab11fip4Q8BQP8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rab11fip4Q8BQP8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab11fip4Q8BQP8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab11fip4Q8BQP8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms