Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK84

Dupd1, Dual specificity phosphatase DUPD1, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dupd1Q8BK84 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Dupd1Q8BK84 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dupd1Q8BK84 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dupd1Q8BK84 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dupd1Q8BK84 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dupd1Q8BK84 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dupd1Q8BK84 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dupd1Q8BK84 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dupd1Q8BK84 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dupd1Q8BK84 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dupd1Q8BK84 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dupd1Q8BK84 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dupd1Q8BK84 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dupd1Q8BK84 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dupd1Q8BK84 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dupd1Q8BK84 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dupd1Q8BK84 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dupd1Q8BK84 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dupd1Q8BK84 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dupd1Q8BK84 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dupd1Q8BK84 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dupd1Q8BK84 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dupd1Q8BK84 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dupd1Q8BK84 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dupd1Q8BK84 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dupd1Q8BK84 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dupd1Q8BK84 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dupd1Q8BK84 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dupd1Q8BK84 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dupd1Q8BK84 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dupd1Q8BK84 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dupd1Q8BK84 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dupd1Q8BK84 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Dupd1Q8BK84 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dupd1Q8BK84 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dupd1Q8BK84 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Dupd1Q8BK84 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dupd1Q8BK84 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dupd1Q8BK84 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dupd1Q8BK84 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dupd1Q8BK84 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dupd1Q8BK84 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dupd1Q8BK84 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dupd1Q8BK84 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dupd1Q8BK84 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dupd1Q8BK84 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Dupd1Q8BK84 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dupd1Q8BK84 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dupd1Q8BK84 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dupd1Q8BK84 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dupd1Q8BK84 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dupd1Q8BK84 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dupd1Q8BK84 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dupd1Q8BK84 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Dupd1Q8BK84 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dupd1Q8BK84 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dupd1Q8BK84 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dupd1Q8BK84 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dupd1Q8BK84 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dupd1Q8BK84 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dupd1Q8BK84 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dupd1Q8BK84 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dupd1Q8BK84 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dupd1Q8BK84 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dupd1Q8BK84 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dupd1Q8BK84 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dupd1Q8BK84 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dupd1Q8BK84 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dupd1Q8BK84 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dupd1Q8BK84 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dupd1Q8BK84 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dupd1Q8BK84 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dupd1Q8BK84 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dupd1Q8BK84 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dupd1Q8BK84 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dupd1Q8BK84 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dupd1Q8BK84 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dupd1Q8BK84 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dupd1Q8BK84 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dupd1Q8BK84 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dupd1Q8BK84 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dupd1Q8BK84 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dupd1Q8BK84 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dupd1Q8BK84 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dupd1Q8BK84 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dupd1Q8BK84 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dupd1Q8BK84 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dupd1Q8BK84 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dupd1Q8BK84 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dupd1Q8BK84 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dupd1Q8BK84 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dupd1Q8BK84 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dupd1Q8BK84 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dupd1Q8BK84 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dupd1Q8BK84 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dupd1Q8BK84 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dupd1Q8BK84 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dupd1Q8BK84 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dupd1Q8BK84 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dupd1Q8BK84 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms