Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ9

Csgalnact1, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 1, mousemouse

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csgalnact1Q8BJQ9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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Csgalnact1Q8BJQ9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csgalnact1Q8BJQ9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csgalnact1Q8BJQ9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csgalnact1Q8BJQ9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csgalnact1Q8BJQ9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csgalnact1Q8BJQ9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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Csgalnact1Q8BJQ9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csgalnact1Q8BJQ9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csgalnact1Q8BJQ9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csgalnact1Q8BJQ9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csgalnact1Q8BJQ9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csgalnact1Q8BJQ9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csgalnact1Q8BJQ9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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Csgalnact1Q8BJQ9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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Csgalnact1Q8BJQ9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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Csgalnact1Q8BJQ9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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Csgalnact1Q8BJQ9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csgalnact1Q8BJQ9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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Csgalnact1Q8BJQ9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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Csgalnact1Q8BJQ9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csgalnact1Q8BJQ9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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Csgalnact1Q8BJQ9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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Csgalnact1Q8BJQ9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csgalnact1Q8BJQ9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csgalnact1Q8BJQ9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csgalnact1Q8BJQ9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csgalnact1Q8BJQ9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csgalnact1Q8BJQ9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csgalnact1Q8BJQ9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csgalnact1Q8BJQ9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csgalnact1Q8BJQ9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csgalnact1Q8BJQ9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csgalnact1Q8BJQ9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csgalnact1Q8BJQ9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csgalnact1Q8BJQ9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csgalnact1Q8BJQ9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csgalnact1Q8BJQ9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csgalnact1Q8BJQ9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csgalnact1Q8BJQ9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csgalnact1Q8BJQ9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csgalnact1Q8BJQ9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csgalnact1Q8BJQ9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csgalnact1Q8BJQ9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csgalnact1Q8BJQ9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csgalnact1Q8BJQ9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csgalnact1Q8BJQ9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csgalnact1Q8BJQ9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csgalnact1Q8BJQ9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csgalnact1Q8BJQ9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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