Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vipas39Q8BGQ1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vipas39Q8BGQ1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vipas39Q8BGQ1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vipas39Q8BGQ1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vipas39Q8BGQ1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Vipas39Q8BGQ1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vipas39Q8BGQ1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vipas39Q8BGQ1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vipas39Q8BGQ1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vipas39Q8BGQ1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vipas39Q8BGQ1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vipas39Q8BGQ1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vipas39Q8BGQ1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vipas39Q8BGQ1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vipas39Q8BGQ1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vipas39Q8BGQ1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vipas39Q8BGQ1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vipas39Q8BGQ1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vipas39Q8BGQ1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vipas39Q8BGQ1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vipas39Q8BGQ1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vipas39Q8BGQ1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vipas39Q8BGQ1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vipas39Q8BGQ1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vipas39Q8BGQ1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vipas39Q8BGQ1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vipas39Q8BGQ1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vipas39Q8BGQ1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vipas39Q8BGQ1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vipas39Q8BGQ1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vipas39Q8BGQ1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vipas39Q8BGQ1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Vipas39Q8BGQ1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vipas39Q8BGQ1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vipas39Q8BGQ1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vipas39Q8BGQ1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vipas39Q8BGQ1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vipas39Q8BGQ1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vipas39Q8BGQ1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vipas39Q8BGQ1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vipas39Q8BGQ1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Vipas39Q8BGQ1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Vipas39Q8BGQ1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vipas39Q8BGQ1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vipas39Q8BGQ1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vipas39Q8BGQ1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vipas39Q8BGQ1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vipas39Q8BGQ1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vipas39Q8BGQ1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vipas39Q8BGQ1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vipas39Q8BGQ1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vipas39Q8BGQ1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vipas39Q8BGQ1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vipas39Q8BGQ1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vipas39Q8BGQ1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vipas39Q8BGQ1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vipas39Q8BGQ1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vipas39Q8BGQ1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vipas39Q8BGQ1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vipas39Q8BGQ1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vipas39Q8BGQ1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vipas39Q8BGQ1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vipas39Q8BGQ1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vipas39Q8BGQ1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vipas39Q8BGQ1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vipas39Q8BGQ1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vipas39Q8BGQ1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vipas39Q8BGQ1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Vipas39Q8BGQ1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vipas39Q8BGQ1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Vipas39Q8BGQ1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vipas39Q8BGQ1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vipas39Q8BGQ1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vipas39Q8BGQ1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vipas39Q8BGQ1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vipas39Q8BGQ1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vipas39Q8BGQ1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vipas39Q8BGQ1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vipas39Q8BGQ1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vipas39Q8BGQ1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vipas39Q8BGQ1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vipas39Q8BGQ1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vipas39Q8BGQ1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vipas39Q8BGQ1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vipas39Q8BGQ1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vipas39Q8BGQ1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vipas39Q8BGQ1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vipas39Q8BGQ1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vipas39Q8BGQ1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vipas39Q8BGQ1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vipas39Q8BGQ1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vipas39Q8BGQ1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vipas39Q8BGQ1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vipas39Q8BGQ1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
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